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一种巨大侧耳PG46菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用 

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申请/专利权人:中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

摘要:本发明涉及巨大侧耳菌种的检测技术领域,公开了一种巨大侧耳PG46菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用,该指纹图谱由10对基于巨大侧耳全基因组测序后开发的SSR分子标记组成,其构建方法包括:菌丝培养;基因组DNA提取;SSR分子标记检测;聚丙烯酰胺凝胶电泳检测;应用包括:对巨大侧耳菌种进行SSR分子标记扩增,将得到的带型与指纹图谱对照,与该指纹图谱一致的即为巨大侧耳PG46菌种。本发明与常规的形态学鉴定、拮抗试验和出菇实验相比,具有检测时间短、准确性高、可重复性好的优点,利用本发明构建的SSR指纹图谱,PG46在这7株不同菌株中具有菌种专一性。

主权项:1.一种巨大侧耳PG46菌种的SSR标记指纹图谱的构建方法,其特征在于,包括:S1、菌丝培养:将巨大侧耳菌种转接到装有20mL的PDA培养基的平板上,28℃恒温暗培养,7天后收集菌丝;S2、基因组DNA的提取:利用植物基因组DNA提取试剂盒提取所述菌丝的基因组DNA,通过琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计法检测基因组DNA的浓度和纯度,并调整样品DNA的浓度为20-30ngμL;S3、SSR分子标记的检测:对提取的基因组DNA进行SSR分子标记的PCR扩增;S4、电泳检测:将扩增得到的PCR产物与上样缓冲液混匀后,电泳,银染,显色,拍照。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 一种巨大侧耳PG46菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用

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