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申请/专利权人:中国农业科学院作物科学研究所
摘要:本发明公开了一种大豆SSR标记高通量多重PCR的方法,涉及分子生物技术领域。通过筛选,本发明从38对SSR引物中筛选到28对可以进行多重毛细管电泳检测的SSR引物,28个SSR标记可以分成3组,与传统的SSR标记检测相比,本发明开发的SSR标记,9‑10对引物可以在一个孔完成PCR扩增和毛细管电泳,大大降低了实验成本,提高了检测效率。利用不同荧光集团标记不同的引物,利用毛细管电泳可以得到每份大豆材料在每个SSR位点的扩增片段长度。
主权项:1.一种大豆SSR标记高通量多重PCR的方法,其特征在于,包括以下SSR引物组序列:引物对1:TCACTTGACTAATCGTGTCATGACA,如SEQIDNo.1所示;AGAATGGACTAACGTTGAGAGGATT,如SEQIDNo.2所示;引物对2:GCTAACCCGCTCTATGTTAAAGTTC,如SEQIDNo.3所示;ATAGAGACAGAGCCAACTCAAACTT,如SEQIDNo.4所示;引物对3:AACACCAAACTATCACTAGGTTTGC,如SEQIDNo.5所示;CCAGGTCACTTACACCTTAACACTA,如SEQIDNo.6所示;引物对4:GATGTCTGCCTCTATGGTAGCTTAA,如SEQIDNo.7所示;AGTAGTTGTAAGCATACCACCATGA,如SEQIDNo.8所示;引物对5:GCAATCAATTTGTGTCTTTATGCCC,如SEQIDNo.9所示;TTTTGAATCCTAGACATGCATGCAA,如SEQIDNo.10所示;引物对6:TCACCATTTAGATTCTTCTCAGGCA,如SEQIDNo.11所示;TTCGTGAGCTATTGTTTTTCATCGT,如SEQIDNo.12所示;引物对7:AGTCATGTCAGCAATTCAGCTTATG,如SEQIDNo.13所示;GTCTCCCTCTCTTTCATTTCTACGA,如SEQIDNo.14所示;引物对8:TCAAATTTTAACCTCAGAGGACAGG,如SEQIDNo.15所示;TGACAATGAAGATAATGATAACAAAATTAGT,如SEQIDNo.16所示;引物对9:ATCATAGTCAGGGGTGGACCTATAT,如SEQIDNo.17所示;AACAACATCATTCTGATCAGTGGTG,如SEQIDNo.18所示;引物对10:GACACCAATCAAAAATTGAACTGCA,如SEQIDNo.19所示;ACTCAACCAATAAAAGAGCATGCAA,如SEQIDNo.20所示;引物对11:TCAAGCACTTTGATTTCCATTCTGT,如SEQIDNo.21所示;CGTGTAGTATAGTTTTGAAAATGGCG,如SEQIDNo.22所示;引物对12:AAAAACCATCCTTACAAAACTGCCA,如SEQIDNo.23所示;TCAGTGGGATCTGATTGTATTTTACC,如SEQIDNo.24所示;引物对13:AAAACATCTCTTCATGCTGTTGTCC,如SEQIDNo.25所示;AAACCTAACTAAGCTTCGGTCTCAA,如SEQIDNo.26所示;引物对14:TGTATACACGAAAGATGGAATATTCTTTT,如SEQIDNo.27所示;TGCCGGAAAATTTTATGGCATAGAT,如SEQIDNo.28所示;引物对15:TTAAGCAGTTCCTCTCATCACGTAA,如SEQIDNo.29所示;TGGATAGTTGACTTTGTTTGGTTGG,如SEQIDNo.30所示;引物对16:AGTTGGTTAAGTCGATTAGGCTTGA,如SEQIDNo.31所示;GCCAAAAATGAGCAAAAATGCAACA,如SEQIDNo.32所示;引物对17:GAGCTATTCCTTTGATTGAAACCCA,如SEQIDNo.33所示;TTGGGAGCTTATACTGAGGTTTCTT,如SEQIDNo.34所示;引物对18:TGTTTAGTCAATTCAGGTCGATAAGT,如SEQIDNo.35所示;GTTCACATGCTTGTACCGATTGATA,如SEQIDNo.36所示;引物对19:CCAGAGTTAACATCTCGGTTTGATG,如SEQIDNo.37所示;AATTTGGCCAAATTCAAACTGGTCA,如SEQIDNo.38所示;引物对20:TTTTAGCCAAAGAACATGTTATGGT,如SEQIDNo.39所示;ACTTTTATTCAACATGCTTTTCATAAGT,如SEQIDNo.40所示;引物对21:CGCCCACCAATAGAAATAATTGTGA,如SEQIDNo.41所示;TGTGATCGGATGTTAATTAGCTTTTTCA,如SEQIDNo.42所示;引物对22:TATCCATCGTGTTGCTGTCATACTT,如SEQIDNo.43所示;ACCATTGTCCTTATCATATTCGTTAAAAA,如SEQIDNo.44所示;引物对23:TAATTCTAGCTGGCCTTTAGAACGT,如SEQIDNo.45所示;ATATTTAAGTGGCGTTGGATTCGAC,如SEQIDNo.46所示;引物对24:GCACACATCATTTCTTTGTTTGACC,如SEQIDNo.47所示;TGTGTTCCGATTTTGATTGCGATAA,如SEQIDNo.48所示;引物对25:TCTTTGTAAGATCACGCCATTATTT,如SEQIDNo.49所示;GTTGCATTGCACATTAGGTTTTCTG,如SEQIDNo.50所示;引物对26:ACAAAAATCAACAACGTTAACAATATAAATT,如SEQIDNo.51所示;GGCAGGGTGGAAGTGAATTTTT,如SEQIDNo.52所示;引物对27:TACGTATTTTCATTGCACAAGTTGT,如SEQIDNo.53所示;TGTCTATGTTCTACCATTAAATGATGACA,如SEQIDNo.54所示;引物对28:ATCCCCAAAGTTATGGAAGAGTCAA,如SEQIDNo.55所示;TCAAGAAACAAAAGGTATGCATGCT,如SEQIDNo.56所示。
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百度查询: 中国农业科学院作物科学研究所 一种大豆SSR标记高通量多重PCR的方法
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