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一种用于鉴别田菁的SSR引物组合及其应用 

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申请/专利权人:中国热带农业科学院湛江实验站

摘要:本发明公开了一种用于鉴别田菁的SSR引物组合及其应用。本发明所述的SSR引物组合包括组合1和或组合2;其中,组合1包括基于田菁叶绿体基因组获得的12对SSR引物对,所述SSR引物对的核苷酸序列依次如SEQIDNO.1~24所示;组合2包括基于田菁转录组获得的9对SSR引物对,所述SSR引物对的核苷酸序列依次如SEQIDNO.25~42所示。利用本发明所述SSR引物组合,可以快速、准确判断田菁的来源以及种类,有利于田菁的种质资源鉴定、种质资源遗传多样性分析和杂交后代鉴定,也有利于田菁种质资源指纹图谱和遗传图谱的构建。

主权项:1.一种用于鉴别田菁的SSR引物组合,其特征在于,包括组合1和或组合2;其中,组合1包括SSR引物对SCC7、SCC9、SCC10、SCC14、SCC19、SCC29、SCC31、SCC32、SCC33、SCC37、SCC53和SCC65;所述引物对SCC7的核苷酸序列如SEQIDNO.1~2所示;所述引物对SCC9的核苷酸序列如SEQIDNO.3~4所示;所述引物对SCC10的核苷酸序列如SEQIDNO.5~6所示;所述引物对SCC14的核苷酸序列如SEQIDNO.7~8所示;所述引物对SCC19的核苷酸序列如SEQIDNO.9~10所示;所述引物对SCC29的核苷酸序列如SEQIDNO.11~12所示;所述引物对SCC31的核苷酸序列如SEQIDNO.13~14所示;所述引物对SCC32的核苷酸序列如SEQIDNO.15~16所示;所述引物对SCC33的核苷酸序列如SEQIDNO.17~18所示;所述引物对SCC37的核苷酸序列如SEQIDNO.19~20所示;所述引物对SCC53的核苷酸序列如SEQIDNO.21~22所示;所述引物对SCC65的核苷酸序列如SEQIDNO.23~24所示;组合2包括SSR引物对SCT3410、SCT8517、SCT12033、SCT15566、SCT27002、SCT37380、SCT51370、SCT51556和SCT54839;所述引物对SCT3410的核苷酸序列如SEQIDNO.25~26所示;所述引物对SCT8517的核苷酸序列如SEQIDNO.27~28所示;所述引物对SCT12033的核苷酸序列如SEQIDNO.29~30所示;所述引物对SCT15566的核苷酸序列如SEQIDNO.31~32所示;所述引物对SCT27002的核苷酸序列如SEQIDNO.33~34所示;所述引物对SCT37380的核苷酸序列如SEQIDNO.35~36所示;所述引物对SCT51370的核苷酸序列如SEQIDNO.37~38所示;所述引物对SCT51556的核苷酸序列如SEQIDNO.39~40所示;所述引物对SCT54839的核苷酸序列如SEQIDNO.41~42所示。

全文数据:

权利要求:

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