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申请/专利权人:云南财经大学
摘要:本发明涉及基因识别技术领域,特别是涉及基于生物功能网络和通路特征优化的癌症驱动基因识别方法,包括:采集若干癌症患者的基因表达数据和基因突变数据并进行处理,构建包含突变基因和表达失调基因的二部图;计算二部图中每对基因的互斥性得分并给二部图加权,获取加权二部图;在加权二部图上采用双向随机游走算法,计算双向随机游走后的转移概率得分以及覆盖率得分;基于转移概率得分和覆盖率得分计算患者之间的相似性得分,并基于相似性得分获取每个患者的驱动基因列表;根据驱动基因列表计算每个基因的累积得分,将累积得分排序前n的基因识别为癌症驱动基因。本发明结合患者分子特征中的异质性和相似性进行分析,提高识别驱动基因的准确性。
主权项:1.基于生物功能网络和通路特征优化的癌症驱动基因识别方法,其特征在于,包括:采集若干癌症患者的基因表达数据和基因突变数据;基于生物功能网络对所述基因表达数据和基因突变数据进行处理,构建包含突变基因和表达失调基因的二部图;计算所述二部图中每对基因的互斥性得分,并基于所述互斥性得分给所述二部图加权,获取加权二部图;在所述加权二部图上采用双向随机游走算法,计算双向随机游走后的转移概率得分以及覆盖率得分;基于所述转移概率得分和覆盖率得分计算患者之间的相似性得分,并基于所述相似性得分获取每个患者的驱动基因列表;根据所述驱动基因列表计算每个基因的累积得分,将累积得分排序前n的基因识别为癌症驱动基因。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 云南财经大学 基于生物功能网络和通路特征优化的癌症驱动基因识别方法
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