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申请/专利权人：梅约医学教育与研究基金会;精密科学公司

摘要：本发明涉及癌症筛查方法及试剂盒、组合物和系统。本发明提供了一种方法，其通过以下来测量人类个体的生物样品中的一种或多种基因的甲基化水平：将生物样品中的基因组DNA用以甲基化特异性方式修饰DNA的试剂处理；使用一组针对所选择的一种或多种基因的引物扩增经过处理的基因组DNA；以及通过聚合酶链式反应、核酸测序、质谱法、甲基化特异性核酸酶、基于质量的分离以及靶标捕获确定所述一种或多种基因的甲基化水平；其中该一种或多种基因选自本发明中表1‑7、9、11‑20、25‑26所示基因的组中一组。本发明提供了筛查子宫内膜癌EC的技术，并且特别但不仅仅是检测子宫内膜癌和各种子宫内膜癌亚型的存在的方法、组合物和相关用途。

主权项：1.一种方法，所述方法包括：通过以下来测量人类个体的生物样品中的一种或多种基因的甲基化水平：将所述生物样品中的基因组DNA用以甲基化特异性方式修饰DNA的试剂处理；使用一组针对所选择的一种或多种基因的引物扩增经过处理的基因组DNA；以及通过聚合酶链式反应、核酸测序、质谱法、甲基化特异性核酸酶、基于质量的分离以及靶标捕获确定所述一种或多种基因的甲基化水平；其中所述一种或多种基因选自以下组中的一组：iAFF3、AIM1_A、AMIGO3_A、BMP4_B、C17orf107_A、C1orf70_B、C5orf52、CLDN7、DIDO1_A、EEF1A2、EMX2OS、FEV、FKBP11_A、GDF6、GDF7_A、JSRP1_A、KCTD15_A、KLHL21、LRRC8D_A、NBPF8、MAX.chr10.130339363-130339534、MAX.chr10.22624479-22624553、MAX.chr14.103021656-103021718、MAX.chr8.145103829-145103992、MAX.chr8.145104263-145104422、MDFI_B、MIAT_A、MMP23B、NDRG2、OBSCN_A、PCOLCE、PYCARD、SEPT9_B、SLC6A3_A、SLC8A3_B、SQSTM1、VILL、ZNF302、ZNF323_A、ZNF506和ZNF90；iiEMX2OS、CYTH2、C17orf107_A、DIDO1_A、GDF6、NBPF8、MAX.chr14.103021656-103021718、JSRP1_A、GATA2_B和SFMBT2_B；iiiSFMBT2_B、ZNF90、MAX.chr8.145103829-145103992、CYTH2、LRRC8D_A、OBSCN_A、DIDO1_A、MAX.chr10.22624479-22624553、JSRP1_A、EMX2OS、NBPF8和MPZ_A；ivEMX2OS、CYTH2、NBPF8、MAX.chr10.22624479-22624553；vANKRD35、ARL5C、ARRB1、BCL2L11_A、BCL2L11_B、BCL2L11_C、BZRAP1、C16orf54、C17orf101、C6orf132、CACNA2D4、DEDD2、EPS15L1、FAIM2、FAM125B、FAM189B、FAM78A、FOXP4、GYPC_A、GYPC_B、IFFO1_A、IFFO1_B、ITPKA、KLF16、LIMD2、LOC389333、LOC440925_A、LOC646278、LYL1、LYPLAL1、MAX.chr11.32355226-32355251、MAX.chr14.102172621-102172686、MAX.chr14.105512122-105512239、MAX.chr15.95128144-95128248、MAX.chr16.11327016-11327312、MAX.chr3.187676577-187676668、MAX.chr4.174430676-174430847、MAX.chr8.145900783-145900914、MAX.chr8.80804237-80804301、N4BP3、NCOR2、NFATC1_A、NFATC1_B、NKX2-6、NR2F6、OSM、PALLD_C、PIK3CD、PRKAR1B、RAD52、STX16_A、SUCLG2、TNFRSF1B、TNFRSF4、ZDHHC18和ZNF671_A；viDIDO1_A、NDRG4、MAX.chr14.103021656-103021718、MMP23B、EMX2OS、SEPT9_B、NBPF8、EEF1A2、AIM1_A、BMP4_B、MAX.chr8.145103829-145103992、OBSCN、PYCARD、GDF6、MDFI_B、MIAT_A、SCL8A3、ZNF323_A、SQSTM1、AFF3、C1orf70、GDF7_A、JSRP1_A、LRRC8D_A、FEV和MAX.chr8.145104263-145104422；viiZNF323_A、MAX.chr7.104624356-104624730、NDRG2、DIDO1_A、MDFI_B、MAX.chr14.103021656-103021718、MMP23B、SEPT9_B和STX16_A；viiiSFMBT2_B、SQSTM1、ZNF323_A、ZNF90、MAX.chr8.145103829-145103992、CYTH2、LRRC8D_A、OBSCN_A、DIDO1_A、MDFI_B、GDF7_A、MAX.chr10.22624479-22624553、JSRP1_A、MAX.chr14.103021656-103021718、EMX2OS、LRRC34、NBPF8、SEPT9_B、EEF1A2、LRRC41_C、VILL和MPZ_A；ixMAX.chr7:104624386-104624529、EMX2OS、DIDO1_B和OBSCN_B；xSFMBT2_B、SQSTM1、ZNF323_A、ZNF506、ZNF90、CLDN7、LRRC41_B、MAX.chr7.104624356-104624730、NDRG2、CYP11A1、MAX.chr8.145103829-145103992、CYTH2、LRRC8D_A、MAX.chr8.145104263-145104422、OBSCN_A、DIDO1_A、GDF6、MAX.chr10.130339363-130339534、MDFI_B、DLL4、GDF7_A、MIAT_A、PYCARD、BMP4_B、JSRP1_A、MAX.chr14.103021656-103021718、EMX2、MMP23B、EMX2OS、MAX.chr17.73073716-73073814、NBPF8、SEPT9_B、LOC440925_A、STX16_A、ITPKA、EEF1A2、FEV、LRRC41_C和NFIC；xiEMX2OS、DIDO1_A、SBNO2、AMIGO3_A、PCOLCE、CLDN7、CYTH2、OBSCN_A、AHSA2、DLL4、EMX2、MAX.chr14.74100620-74100870、LRRC4、PPP2R5C_A、SQSTM1、MAX.chr17.73073716-73073814、CYP11A1、ACOXL_A和AIM1_B；xiiEMX2OS和LRRC34；xiiiZNF506、ZNF90、MAX.chr8.145103829-145103992、LRRC8D_A、OBSCN_A、MAX.chr10.22624479-22624553、JSRP1_A、EMX2OS、NBPF8和VILL；xivTRH、MAX.chr7:104624386-104624529、EMX2OS、DIDO1_B和ST3GAL2_B；xvSFMBT2_B、SMTN、ZNF506、ZNF90、CLDN7、LRRC41_B、CYP11A1、MAX.chr8.145103829-145103992、AHSA2、CYTH2、GATA2_B、LRRC8D_A、MAX.chr8.145104263-145104422、OBSCN_A、DIDO1_A、GDF6、DLL4、MAX.chr10.22624479-22624553、PYCARD、BMP4_B、JSRP1_A、MAX.chr14.103021656-103021718、MIAT_B、EMX2OS、LRRC34、NBPF8、LOC440925_A、ITPKA、NFIC和VILL；xviEMX2OS、KANK1、C1orf70_B、AMIGO3_A、DIDO1_A、LRRC41_C、NFIC、FKBP11_A、C17orf107_A、SMTN、LRRC41_B、LRRC8D_A、OBSCN_A、MAX.chr7.104624356-104624730、MIAT_B；xviiMAX.chr7.104624356-104624730、EMX2OS和LRRC41_C；xviiiMAX.chr8.145103829-145103992、CYTH2、LRRC8D_A、OBSCN_A、DIDO1_A、EMX2OS、LRRC41_C和VILL；xixEMX2OS和LRRC41_D；xxSFMBT2_B、SMTN、SQSTM1、ZNF90、CLDN7、LRRC41_B、MAX.chr7.104624356-104624730、CYP11A1、FKBP11_A、MAX.chr8.145103829-145103992、AHSA2、CYTH2、LRRC8D_A、MAX.chr8.145104263-145104422、OBSCN_A、GDGF6、DLL4、PYCARD、BMP4_B、JSRP1_A、MIAT_B、KANK1、EMX2OS、NBPF8、LOC440925_A、ITPKA、EEF1A2、FEV、LRRC41_C、NFIC、VILL、MPZ_A；xxiMAX.chr10.130339363-130339534、SFMBT2_C、CYTH2、SLC6A3、VILL、EMX2OS、MAX.chr10.22624479-22624553、GDF6、ZNF90、ZNF506、JSRP1_A、c5orf52、SFMBT2_B、NBPF8、RHBDL1_A、DIDO1_A、KANK1和GATA2_B；xxiiMAX.chr8.145103829-145103992、CYTH2、DIDO1_A、MAX.chr10.22624479-22624553、JSRP1_A、SBNO2、NBPF8和VILL；xxiiiSFMBT2_B、ZNF90、MAX.chr8.145103829-145103992、CYTH2、MAX.chr8.145104263-145104422、OBSCN_A、MAX.chr10.22624479-22624553、JSRP1_A、EMX2OS、NBPF8和MPZ_A；xxivSFMBT2_B、SMTN、SQSTM1、ZNF506、ZNF90、CLDN7、LRRC41_B、FKBP11_A、MAX.chr8.145103829-145103992、AHSA2、CYTH2、GATA2_B、LRRC8D_A、MAX.chr8.145104263-145104422、DIDO1_A、GDF6、MAX.chr10.130339363-130339534、DLL4、MAX.chr10.22624479-22624553、MIAT_A、PYCARD、BMP4_B、JSRP1_A、MAX.chr14.103021656-103021718、MIAT_B、KANK1、SBNO2、c5orf52、EMX2O6、LRRC34、NBPF8、LOC440925_A、ITPKA、NFIC、VILL和MPZ_A；xxvTSPYL5、TRH、JAM3、FAM19A5、PTGDR、SFMBT2_E、JSRP1_B和ARL5C；xxviTSPYL5、MPZ_B、TRH、CNTN4、FAM19A5、GLT1D1、RYR2_F、PTGDR、EMX2OS、MAX.chr10:22624470-22624553、SPDYA_B、SFMBT2_E和JSRP1_B；以及xxviiTSPYL5、MPZ_B、TRH和PTGDR。

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