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申请/专利权人:北赛泓升(北京)生物科技有限公司
摘要:本发明涉及干细胞技术领域,具体涉及一种多能干细胞多能性的评价方法和系统。本发明提供的基因标志物组合能够更为全面、准确、客观地反映多能干细胞的多能性,通过主成分分析,基因标志物组合在不同多能干细胞样本间的PCA结果相关性好、可重复性高、分辨率高、生物意义显著、主成分空间分布非常集中,并且在未分化的多能干细胞中具有低背景。基于所述基因标志物组合建立的多能干细胞的多能性评价方法以量化的评分方式评价多能干细胞的分化潜能,该方法普适性好、易于标准化,为多能干细胞的克隆筛选、表征和质量控制提供有效的依据。
主权项:1.基因标志物组合,其特征在于,所述基因标志物组合至少包括选自四种基因标志物中的一种或多种,所述四种基因标志物为干性基因标志物、外胚层分化基因标志物、中胚层分化基因标志物和内胚层分化基因标志物;其中,所述干性基因标志物包括CNMD、CXCL5、DNMT3B、DPPA5、ESRG、HESX1、IDO1、LCK、LIN28A、NANOG、POU5F1、SOX2、TDGF1、TERT、TRIM22、USP44和ZFP42;所述外胚层分化基因标志物包括CDH9、COL2A1、DLK1、DMBX1、DMRT3、DRD4、EN1、FABP7、FGF5、GAD1、HES5、LHX2、LMX1A、MAP2、MEIS1、MYO3B、NCAM1、NES、NEUROD1、NOS2、NR2F1、NR2F2、OLFM3、OTX1、OTX2、PAPLN、PAX3、PAX6、POU4F1、RAX、SOX1、STMN4、TFAP2A、TFPI、TUBB3、WNT1和ZBTB16;所述中胚层分化基因标志物包括ABCA4、ALOX15、APLNR、BMP10、CD36、CDH5、CDX2、COLEC10、TNNT2、ESM1、FOXF1、HAND1、HAND2、HEY1、HOPX、HOXB7、HOXC8、IL10、IL6ST、ISL1、KDR、LHX1、MEOX1、MESP1、MESP2、MIXL1、MSGN1、MYH6、NKX2-5、ODAM、OSR1、PDGFRA、PLVAP、PPARG、RGS4、SNAI2、TAGLN、TBX3、TBX6、TDO2、TM4SF1和TWIST1;所述内胚层分化基因标志物包括AFP、ALB、CABP7、CDH1、CDH2、CDH20、CER1、CLDN1、CPLX2、CXCR4、EOMES、FOXA1、FOXA2、FOXP2、GATA4、GATA5、GATA6、GREM2、GSC、HHEX、NGS2、HNF1A、HNF1B、HNF4a、KLF5、LEFTY2、MUC2、NODAL、PARP6、POU3F3、PRDM1、RXRG、SERHL2、SMAD2、SMAD3、SNAI1、SOX17、SOX7、SOX9、SST、VIL1和WNT3。
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