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申请/专利权人：中山大学
摘要：本发明涉及药物设计技术领域，公开了基于自适应往返增强采样预测结合自由能的方法及系统，包括以下具体步骤：构建基础自由能扰动参数和自适应往返增强采样参数文件；切分自由能扰动过程的窗口方案；对第一部分的窗口进行1次正向分子动力学模拟和往返分子动力学模拟，进行往返增强采样；动态评估最后1次正向分子动力学模拟的收敛性，若判断不收敛则重新进行往返分子动力学模拟，若判断收敛则进行下一部分窗口的往返增强采样；基于窗口模拟计算结合自由能。本发明解决了现有技术计算结合自由能成本高的问题，且具有能够提高采样效率并减少计算浪费，加速药物设计技术领域对药物‑靶标亲和力的预测的特点。
主权项：1.基于自适应往返增强采样预测结合自由能的方法，其特征在于，包括以下具体步骤：构建基础自由能扰动参数和自适应往返增强采样参数文件；根据设定的分段窗口步长，切分自由能扰动过程的窗口方案；通过对第一部分的窗口进行1次正向分子动力学模拟和至少1次往返分子动力学模拟，进行往返增强采样；动态评估最后1次正向分子动力学模拟的收敛性，若判断不收敛则重新进行往返分子动力学模拟，若判断收敛则进行下一部分窗口的往返增强采样；持续进行往返增强采样与动态收敛性判断，直到完成所有部分的窗口模拟；基于窗口模拟计算结合自由能。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中山大学 基于自适应往返增强采样预测结合自由能的方法及系统
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