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在聚合物基质中锚定片段化核酸靶标以用于成像的方法 

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摘要:本公开文本总体上涉及用于将核酸锚定在基质中并随后使组织样品例如福尔马林固定的石蜡包埋的FFPE组织切片内的核酸靶标例如RNA转录物分子成像的方法,其中所述核酸可以被片段化。例如,本文提供了一种将靶核酸锚定在基质内并清理非靶细胞组分的方法,并且所述方法包括使组织样品与至少两种锚定剂接触,其中所述第一锚定剂与所述靶核酸形成共价键,并且所述第二锚定剂含有与所述靶核酸杂交的寡核苷酸;将所述样品包埋在聚合物基质中,其中所述第一锚定剂和所述第二锚定剂各自与所述聚合物基质形成共价键;以及从所述聚合物基质清理所述非靶细胞组分,其中所述靶核酸保持锚定在所述聚合物基质中,以形成基质锚定的靶核酸样品。另外的步骤包括:使所述锚定的靶核酸样品与一个或多个初级寡核苷酸探针接触,所述一个或多个初级寡核苷酸探针与所述靶核酸和多个二级核酸探针杂交,所述二级核酸探针含有荧光标记以及与所述初级核酸探针的序列杂交的识别序列;以及使所述靶核酸成像。

主权项:1.一种将靶核酸锚定在基质内并清理非靶细胞组分的方法,所述方法包括:a.使福尔马林固定的石蜡包埋的FFPE组织样品与至少两种锚定剂接触,其中所述第一锚定剂与所述靶核酸形成共价键,并且所述第二锚定剂包含与所述靶核酸杂交的寡核苷酸;b.将所述样品包埋在聚合物基质中,其中所述第一锚定剂和所述第二锚定剂各自与所述聚合物基质形成共价键;以及,c.从所述聚合物基质清理所述非靶细胞组分,其中所述靶核酸保持锚定在所述聚合物基质中,以形成基质锚定的靶核酸样品。

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