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摘要：本发明公开了一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用，属于基因检测技术领域。本发明包括序列数据的预处理、比对、注释和功能分析等步骤，通过对古代宏基因组片段进行高效、准确的数据处理和分析，能够揭示古代生物群体的遗传信息及其演化历史，为考古学、遗传学和环境科学等领域提供重要的数据支持和技术指导。本发明不仅能够克服传统方法的局限性，适应不同类型的古代样本，还能提供更全面的遗传信息，推动古代宏基因组研究的深入发展。通过新方法的开发和应用，研究人员将能够更准确地解析古代微生物群落的结构和功能。
主权项：1.一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）样本采集与处理：从古代生物遗骸中提取样本并进行预处理，并进行双端建库测序；（2）序列数据的预处理：首先使用质量控制软件进行数据校正，挑选测序数据中的DNA片段，使用双端合并软件对经过挑选的测序数据进行双端合并，取能够成功合并的片段进行后续分析；（3）序列比对：使用DNA片段进行拼接为重叠群contig，使用contig作为参考与目标DNA片段进行对比；（4）损伤评估：使用古代DNA评估软件进行估目标片段与重叠群的对比度，挑选鉴定目标DNA片段的损伤片段，标记目标DNA片段的损伤率；（5）古代DNA挑选：根据不同年代的损伤率，挑选不同损伤率的片段为古代DNA。
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百度查询： 中国海洋大学 一种基于双端测序的古代宏基因组片段鉴定方法及其应用
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