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微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统 

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摘要:本申请公开了一种微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统。该数据库的构建方法包括:采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集;采用微生物富集方法分别对血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理,得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集;采用质谱法分别对阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定,获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图;根据阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰;根据阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。利用构建的数据库,可以消除血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰因素的影响,提高了鉴定准确性,缩短鉴定时间,提高鉴定效率。

主权项:1.一种微生物鉴定用数据库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括:采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集;采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理,得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集;采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定,获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图;根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰;其中,所述非病原菌蛋白特征峰中非病原菌蛋白包括血浆蛋白、血小板或细胞碎片;根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰;其中,根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰,包括:所述阳性微生物集包括个阳性样本,每个阳性样本至少包括种菌株,对每种菌株至少点样次;其中,、、分别为大于等于1的自然数;则每个阳性样本对应获得个阳性样本质谱图,个阳性样本对应获得个阳性样本质谱图,即阳性样本集质谱图包括个阳性样本质谱图;将个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比,将个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图在相同的出峰位置出现的离子峰定义为该阳性微生物的保守特征峰,依次获得个阳性微生物的所有保守特征峰;且将满足以下条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的保守特征峰,以下条件包括:将质荷比在个阳性样本质谱图中出现的次数:,在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不小于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之二;将满足以下条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的专属特征峰,以下条件包括:将质荷比在个阳性样本质谱图内的出现次数:,在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不大于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之一。

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百度查询: 中元汇吉生物技术股份有限公司 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统

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