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摘要：本发明公开了一种基于分子模拟对接的蛋白质序列筛选方法，包括以下步骤：A、将待筛选的蛋白质序列作为底物，将蛋白质序列数据库中的蛋白质序列作为受体；B、使用受体对底物进行空间匹配；C、对匹配后的蛋白质序列进行能量评估，选择能量最小的匹配结果作为底物和受体的对接结果；D、根据预设的受体筛选条件对步骤C中得到的对接结果中的受体进行筛选，与筛选出受体匹配的底物为筛选出的蛋白质序列。本发明能够改进现有技术的不足，提高了分子对接的效率。
主权项：1.一种基于分子模拟对接的蛋白质序列筛选方法，其特征在于包括以下步骤：A、将待筛选的蛋白质序列作为底物，将蛋白质序列数据库中的蛋白质序列作为受体；B、使用受体对底物进行空间匹配；使用受体对底物进行空间匹配包括以下步骤，B1、导入受体分子；B2、对受体分子进行修饰；对受体分子进行修饰包括以下步骤，B21、确定受体分子上的可旋转键；B22、随机对若干个可旋转键上的原子替换为氢原子；B23、修改残基中的非整数电荷，消除非整数电荷；B3、对底物分子进行修饰；B4、将经过修饰的受体和底物进行刚性对接；将经过修饰的受体和底物进行刚性对接包括以下步骤，B41、将受体和底物进行随机对接，在对接结果中标识出对接成功点和对接失败点；B42、记录对接失败点的对接结构，记录对接成功点的对接结构出现次数；B43、返回步骤B41进行下一次对接，对接时规避对接失败点的对接结构，同时依据对接成功点的对接结构出现次数由多至少的顺序，优先使用对接成功点的对接结构进行对接；B44、重复步骤B41～B43，直至受体和底物完全对接成功；C、对匹配后的蛋白质序列进行能量评估，选择能量最小的匹配结果作为底物和受体的对接结果；D、根据预设的受体筛选条件对步骤C中得到的对接结果中的受体进行筛选，与筛选出受体匹配的底物为筛选出的蛋白质序列。
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百度查询： 李红臣 一种基于分子模拟对接的蛋白质序列筛选方法
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