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摘要:本发明提供了一种蛋白质复合物识别方法、系统、设备及存储介质,属于生物数据智能分析领域,包括:获取所需的蛋白质互作用网络数据,以及蛋白质对应的GO信息和基因表达数据;针对蛋白质互作用网络,结合蛋白质的GO信息和基因表达数据构建加权蛋白质互作用网络G;将G表示成邻接矩阵A,并对A进行归一化,得到邻接相似度矩阵SA,将SA作为特征矩阵进行图卷积,并计算每层图卷积的高阶相似矩阵SK;将每层SK结合起来形成总相似矩阵S,并通过MCL得到初始蛋白质簇集合;利用适应度函数对初始蛋白质簇集合中的蛋白质进行更新迭代;对得到的蛋白簇进行筛选操作,从而得到最终的蛋白质复合物。本发明旨在融合高阶结构信息和生物信息,从而提高蛋白质复合物检测的准确度。
主权项:1.一种蛋白质复合物识别方法,其特征在于,包括以下步骤:获取所需的蛋白质互作用网络数据,以及蛋白质对应的GO信息和基因表达数据;针对蛋白质互作用网络,结合蛋白质的GO信息和基因表达数据构建加权蛋白质互作用网络G;将加权蛋白质互作用网络G表示成邻接矩阵A,并对邻接矩A进行归一化,得到邻接相似度矩阵SA;将SA作为特征矩阵进行图卷积,并计算每层图卷积的高阶相似矩阵SK;将得到的每层高阶相似矩阵SK结合起来形成总相似矩阵S,并通过马尔科夫聚类MCL从总相似矩阵S中得到初始蛋白质簇集合;利用适应度函数对初始蛋白质簇集合中的蛋白质进行更新迭代;对更新迭代得到的蛋白簇进行筛选操作,从而得到最终的蛋白质复合物。
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权利要求:
百度查询: 山西大学 一种蛋白质复合物识别方法、系统、设备及存储介质
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