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申请/专利权人：广西大学

摘要：本发明公开了南丹瑶鸡蛋壳颜色关联SNP分子标记的筛选方法：1从已知文献中找出与蛋品质相关的基因，设计引物；取南丹瑶鸡，采血提基因组DNA，混池测序；2取南丹瑶鸡母鸡作为试验鸡，从24周龄开始测鸡蛋的蛋壳颜色形状指标，60周龄结束；3采集60周龄试验鸡的血液并提取基因组DNA，对检测到的SNP位点PCR测序；4整理测序数据和蛋壳颜色数据，筛选出与蛋壳颜色显著关联的候选SNP位点，为蛋壳颜色选育提供SNP分子标记理论依据。本发明可应用于提高南丹瑶鸡鸡蛋蛋壳颜色的快速简捷培育的方法，简化了全基因组关联分析直接对性状相关基因进行SNP标记的筛选，适用于高遗传力的数量性状的选育。

主权项：1.一种17个SNP位点在制备试剂盒或检测方法中的应用，其特征在于：所述试剂盒或检测方法的用途为用于南丹瑶鸡的产蛋周期蛋壳颜色关联的性状辅助育种；其中，所述17个SNP分子标记为：Chr1_68526357、Chr12_3349437、Chr12_3351732、Chr4_16561950、Chr4_16561983、Chr1_65258094、Chr9_4769841、Chr9_4769902、Chr1_85290873、Chr1_65258484、Chr12_3349335、Chr9_4769654、Chr9_4769728、Chr9_4771498、Chr9_4771726、Chr9_4771736、Chr9_4772471与产蛋周期蛋壳颜色关联；所述Chr1_68526357位点位于SEQIDNO:1所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有GG、GA、AA三种基因型，其中GA型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr12_3349437位点位于SEQIDNO:2所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有CC、CT两种基因型，其中CC型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr12_3351732位点位于SEQIDNO:3所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有AA、AG两种基因型，其中AG型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr4_16561950位点位于SEQIDNO:4所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有GG、GA两种基因型，其中GA型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr4_16561983位点位于SEQIDNO:5所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有CC、CT、TT三种基因型，其中CT型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr1_65258094位点位于SEQIDNO:6所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有AA、AT两种基因型，其中AA型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4769841位点位于SEQIDNO:7所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有CC、CT、TT三种基因型，其中TT型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4769902位点位于SEQIDNO:8所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有AA、AG、GG三种基因型，其中GG型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr1_85290873位点位于SEQIDNO:9所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有CC、CG、GG三种基因型，其中GG型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr1_65258484位点位于SEQIDNO:10所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有CC、CT、TT三种基因型，其中CT型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr12_3349335位点位于SEQIDNO:11所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有GG、GA两种基因型，其中GG型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4769654位点位于SEQIDNO:12所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有TT、TC两种基因型，其中TC型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4769728位点位于SEQIDNO:13所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有AA、AG、GG三种基因型，其中AA型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4771498位点位于SEQIDNO:14所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有GG、GA两种基因型，其中GA型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4771726位点位于SEQIDNO:15所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有GG、GT两种基因型，其中GT型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4771736位点位于SEQIDNO:16所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有GG、GT两种基因型，其中GT型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深；所述Chr9_4772471位点位于SEQIDNO:17所示的核苷酸序列的第101位，该位置处有AA、AG两种基因型，其中AG型个体的鸡蛋蛋壳颜色最深。

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百度查询： 广西大学 南丹瑶鸡蛋壳颜色关联SNP分子标记的筛选方法及用途