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申请/专利权人：哈尔滨学院
摘要：父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统及方法，涉及生物统计学技术领域。本发明是为了解决现有基因关联检测方法还存在难以克服群体分层的影响，从而导致无法实现在家庭型数据框架下基因与性状的关联检测问题。本发明包括：信息获取模块，主成分提取模块，家庭内部相关性统计量构造模块，全部家庭数据关联检测统计量获取模块，基因关联检测模块；信息获取模块用于获取标记位点信息、性状信息；主成分提取模块用于提取信息主成分；家庭内部相关性统计量构造模块用于构造家庭内部相关性统计量；全部家庭数据关联检测统计量获取模块用于取全部家庭数据关联检测统计量；所述基因关联检测模块用于进行基因关联检测。本发明用于基因关联检测。
主权项：1.父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统，其特征在于：所述系统包括：信息获取模块，主成分提取模块，家庭内部相关性统计量构造模块，全部家庭数据关联检测统计量获取模块，基因关联检测模块；所述信息获取模块用于获取父母子三元亲属结构家庭成员基因组上的标记位点信息xijl以及性状信息yijl；其中，xijl和yijl分别表示第i个子群体第j个家庭中第l个个体的基因型得分和数量性状值；所述主成分提取模块用于提取信息获取模块获取的信息主成分tijl＝tijl1,…,tijlf；其中，f是主成分的总数量；所述家庭内部相关性统计量构造模块用于根据xijl和yijl和tijl构造家庭内部相关性统计量Uij：步骤一、建立主成分tijl＝tijl1,…,tijlf与yijl的广义线性函数和主成分tijl＝tijl1,…,tijlf与候选标记点位信息x1ijl的广义线性函数：yijl＝g1tijl+ψijlx1ijl＝g2tijl+εijl其中，ψijl是随机变量，εijl是随机变量，g1tijl和g2tijl是模型核心函数；步骤二、利用步骤一获取的广义线性函数获取家庭内部的相关性统计量Uij；所述全部家庭数据关联检测统计量获取模块用于根据Uij获取全部家庭数据关联检测统计量；所述基因关联检测模块用于根据获取全部家庭数据关联检测统计量的统计P值，并根据统计P值确定基因与性状信息是否有关联。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 哈尔滨学院 父母子三元亲属结构的候选区域基因关联检测系统及方法
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