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一种蝉花菌株的RAPD分子标记鉴定方法 

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申请/专利权人:浙江泛亚生物医药股份有限公司

摘要:本发明提供一种蝉花单17‑7‑1菌株的鉴定方法,包括提取待检测菌株的DNA;对待检测菌株DNA采用引物S11进行PCR扩增;获得的扩增产物经琼脂糖凝胶电泳后获得待检测菌株的RAPD条带图谱;将获得的待检测菌株RAPD图谱进行分析获得判定结果。采用本发明鉴定方法,可快速、准确的鉴定蝉花单17‑7‑1菌株。

主权项:1.一种蝉花单17-7-1菌株的鉴定方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:步骤1,提取待检测菌株的DNA;步骤2,对步骤1获得的待检测菌株DNA采用引物进行PCR扩增,引物序列为SEQIDNO:1;步骤3,将步骤2获得的扩增产物经琼脂糖凝胶电泳后获得待检测菌株的RAPD条带图谱;步骤4,将步骤3获得的待检测菌株RAPD图谱进行分析获得判定结果;所述步骤4中,将步骤3获得的RAPD条带图谱进行分析,待检测菌株在3000bp~2000bp之间具有一条条带,鉴定待检测菌株为蝉花菌株单17-7-1菌株;所述蝉花单17-7-1菌株的保藏号为CGMCCNo.3453。

全文数据:一种蝉花菌株的RAPD分子标记鉴定方法技术领域本发明涉及一种蝉花菌株的鉴定方法,属于分子生物学技术领域。背景技术蝉花,别名虫花,是某些蝉若虫受蝉花寄生后的产物,是一种菌虫复合体。此菌于1838年由Miquel定名为蝉棒束孢霉Isariacicadae。此后出现多种同物异名,如蝉草Cordycepscicadae,辛克莱球壳孢Sphaeriasinclairii,辛克莱虫草Cordycepssinclairii,辛克莱棒束孢Isariasinclairii,基生棒束孢Isariabasili,丛生虫壳菌Torrubiacaespitosa,哈里棒束孢Isariahariottii,小蝉茸Cordycepssobolifera,蒙克苏棒束孢Isariamokanshawii和多枝棒束孢Isariaarbuscula等等。常采到的是蝉花及其寄主山蝉若虫寄生后的复合体。根据历史产区浙江的1467份样品的调查,药材蝉花主要是蝉花寄生后的虫菌复合体。蝉花属半知菌类真菌,其子实体自虫体头部长出,单生或丛聚成束,浅黄色,长1.5~8.0cm,前端膨大,呈纺锤形或呈鸡冠花状。该蝉花采用如下方法进行培养:从液氮中取出蝉花单17-7-1和其他不同地域蝉花的保藏样品,在超净工作台上将其接到PSA斜面培养基上,22℃-25℃培养10d,然后在超净工作台将PSA斜面培养基中长好的蝉花接到SAAY液体培养基中,22℃-25℃摇菌24h,收集菌丝并液氮速冻,-80℃保存备用。蝉花单17-7-1的主要形态特征为:在PDA培养基上25℃培养10d,菌落圆形,平展,初絮状,后粉状,白色至浅黄色,直径5~6cm。菌丝无色,分枝,具有隔膜,宽1.2~2.5μm。分生孢子梗多分枝,宽3.0~5.5μm,由每轮2~5个个产孢细胞组成轮状分枝。产孢细胞瓶形,基部球状膨大,向上变细窄,4.5~6.5×2.5~3.5μm。分生孢子圆柱形,单细胞,无色,平滑,链生,直或弯曲,6.5~8.8~11.0×2.5~3.5μm。蝉花单17-7-1经实验验证,其培养物具有易于培养、产量高的特点,具有抗肿瘤、调节免疫、降血糖、降血脂、降血压、明目、抗辐射、解热镇痛、镇静催眠、滋补强壮、改善肾功能等功能,因此具有广泛的工业化应用价值。由于地理来源不同、寄主不同的蝉花,其次生代谢产物方面具有较大的变异性。本专利的目的是利用RAPD分子标记技术鉴定蝉花单17-7-1菌株和其他不同地域蝉花的区别。发明内容本发明的目的在于提供蝉花单17-7-1菌株的鉴定方法。本发明的目的是通过如下技术方案实现的:一种蝉花单17-7-1菌株的鉴定方法,该方法包括如下步骤:步骤1,提取待检测菌株的DNA;步骤2,对步骤1获得的待检测菌株DNA采用下列引物进行PCR扩增,S11:GTAGACCCGTSEQIDNO:1;步骤3,将步骤2获得的扩增产物经琼脂糖凝胶电泳后获得待检测菌株的RAPD条带图谱;步骤4,将步骤3获得的待检测菌株RAPD图谱进行分析获得判定结果。进一步的,所述步骤2所采用的PCR扩增反应体系如下:总体积50μL,DNA样本:50ng,dNTP:6nmol,引物:20pmol,Taq酶:2U,Buffer:5μL,加ddH2O至50μL。进一步的,所述步骤2所采用的PCR扩增反应条件如下:先95℃5分钟;然后依次95℃40秒,38℃1分钟,72℃2分钟,共循环40次;然后72℃延伸10分钟,最后降温至4℃保存。进一步的,所述步骤4中,将步骤3获得的RAPD条带图谱进行分析,如果待检测菌株在3000bp~2000bp之间具有一条条带,则鉴定待检测菌株为蝉花菌株单17-7-1菌株。本发明涉及的蝉花菌株为浙江泛亚生物医药股份有限公司所有,编号为单17-7-1已于2009年11月18日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心简称CGMCC注册保藏,保藏号为CGMCCNo.3453。本发明有益效果:本发明通过筛选大量的随机引物最终获得本发明引物,该引物具有非常高的特异性,具有唯一的特异性条带在3000bp~2000bp之间,能很好的区分生产菌株单17-7-1和其他不同地域蝉花。由于目前其他菌株并未进行过全基因组测序,如果要从整个基因组区分不同地域蝉花分子水平的不同,则需要对其他不同地域蝉花进行重测序每个样至少还需要三次重复,再进行个体差异性分析,需要消耗大量的金钱,大量的时间。相对于以往的蝉花全基因组测序结果,本发明RAPD分子标记只是一段10nt碱基的引物随机结合到DNA上的,只需通过PCR和电泳就能得到结果,具有耗时短,价格低,操作简便的特点。附图说明图1为引物S6对应的RAPD条带图谱;图2为引物S7对应的RAPD条带图谱;图3为引物S10对应的RAPD条带图谱;图4为引物S30对应的RAPD条带图谱;图5为引物S31对应的RAPD条带图谱;图6为引物S33对应的RAPD条带图谱;图7为引物S37对应的RAPD条带图谱;图8为引物S46对应的RAPD条带图谱;图9为引物S61对应的RAPD条带图谱;图10为引物S67对应的RAPD条带图谱;图11为引物S92对应的RAPD条带图谱;图12为引物S103对应的RAPD条带图谱;图13为引物S136对应的RAPD条带图谱;图14为引物S140对应的RAPD条带图谱;图15为引物S151对应的RAPD条带图谱;图16为引物S216对应的RAPD条带图谱;图17为引物S219对应的RAPD条带图谱;图18为引物S11对应的RAPD条带图谱;图19为引物S9对应的RAPD条带图谱;图20为引物S12对应的RAPD条带图谱;图21为引物S21对应的RAPD条带图谱;图22为引物S34对应的RAPD条带图谱;图23为引物S35对应的RAPD条带图谱;图24为引物S36对应的RAPD条带图谱;图25为引物S41对应的RAPD条带图谱;图26为引物S42对应的RAPD条带图谱;以上图1-17中,泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为IC407的PCR结果,泳道3为15LQ4的PCR结果,泳道4为15FY13的PCR结果,泳道5为16JR41的PCR结果,泳道6为Marker,泳道7为16JR42的PCR结果,泳道8为15AX22的PCR结果,泳道9为16AJ26的PCR结果,泳道10为15JGS4的PCR结果,泳道11为14DBS50的PCR结果;以上图18中,泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为15JJ5的PCR结果,泳道3为15JJ7的PCR结果,泳道4为15JJ8的PCR结果,泳道5为15JJ10的PCR结果,泳道6为15JJ14的PCR结果,泳道7为Marker,泳道8为单17-7-1的PCR结果,泳道9为15JJ17的PCR结果,泳道10为15JJ18的PCR结果,泳道11为15AX22的PCR结果,泳道12为15AX27的PCR结果,泳道13为15AX30的PCR结果;以上图19-26中,泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为15JJ8的PCR结果,泳道3为15JJ10的PCR结果,泳道4为15JJ14的PCR结果,泳道5为15JJ18的PCR结果,泳道6为15AX27的PCR结果,泳道7为Marker,泳道8为单17-7-1的PCR结果,泳道9为15AX30的PCR结果,泳道10为15AX36的PCR结果,泳道11为15AX39的PCR结果,泳道12为15JGS35的PCR结果,泳道13为15JGS38的PCR结果;图27为引物S11对应的RAPD条带图谱泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为15JJ5的PCR结果,泳道3为15JJ7的PCR结果,泳道4为15JJ8的PCR结果,泳道5为15JJ10的PCR结果,泳道6为15JJ14的PCR结果,泳道7为Marker,泳道8为单17-7-1的PCR结果,泳道9为15JJ17的PCR结果,泳道10为15JJ18的PCR结果,泳道11为15AX22的PCR结果,泳道12为15AX27的PCR结果,泳道13为15AX30的PCR结果,其中泳道7Marker条带按照分子量大小从上往下顺序依次为:10000bp,5000bp,3000bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp;泳道1为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道2为15JJ5的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道3为15JJ7的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道4为15JJ8的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道5为15JJ10的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道6为15JJ14的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,250bp~300bp之间;泳道8为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道9为15JJ17的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。泳道10为15JJ18的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道11为15AX22的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道12为15AX27的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道13为15AX30的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。图28为引物S11对应的RAPD条带图谱泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为15AX33的PCR结果,泳道3为15AX34的PCR结果,泳道4为15AX36的PCR结果,泳道5为15AX38的PCR结果,泳道6为15AX39的PCR结果,泳道7为Marker,泳道8为单17-7-1的PCR结果,泳道9为15JGS2的PCR结果,泳道10为15JGS4的PCR结果,泳道11为15JGS11的PCR结果,泳道12为15JGS35的PCR结果,泳道13为15JGS38的PCR结果,其中泳道7Marker条带按照分子量大小从上往下顺序依次为:10000bp,5000bp,3000bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp;泳道1为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道2为15AX33的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间;泳道3为15AX34的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道4为15AX36的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道5为15AX38的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道6为15AX39的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道8为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道9为15JGS2的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道10为15JGS4的RAPD条带大小估算为无;泳道11为15JGS11的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道12为15JGS35的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道13为15JGS38的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。图29为引物S11对应的RAPD条带图谱泳道1Marker,泳道2为单17-7-1的PCR结果,泳道3为15FY8的PCR结果,泳道4为15FY13的PCR结果,泳道5为15FY14的PCR结果,泳道6为15LQ4的PCR结果,泳道7为14DBS50的PCR结果,其中泳道1Marker条带按照分子量大小从上往下顺序依次为:10000bp,5000bp,3000bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp;泳道2为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道3为15FY8的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,250bp~300bp之间;泳道4为15FY13的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间;泳道5为15FY14的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,250bp~300bp之间;泳道6为15LQ4的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,750bp~500bp之间;泳道7为14DBS50的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。图30为引物S11对应的RAPD条带图谱泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为15JJ5的PCR结果,泳道3为15JJ7的PCR结果,泳道4为15JJ8的PCR结果,泳道5为15JJ10的PCR结果,泳道6为15JJ14的PCR结果,泳道7为Marker,泳道8为单17-7-1的PCR结果,泳道9为15JJ17的PCR结果,泳道10为15JJ18的PCR结果,泳道11为15AX22的PCR结果,泳道12为15AX27的PCR结果,泳道13为15AX30的PCR结果,其中泳道7Marker条带按照分子量大小从上往下顺序依次为:10000bp,5000bp,3000bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp;泳道1为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道2为15JJ5的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道3为15JJ7的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道4为15JJ8的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道5为15JJ10的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道6为15JJ14的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,250bp~300bp之间;泳道8为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道9为15JJ17的RAPD条带大小估算为4000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道10为15JJ18的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道11为15AX22的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道12为15AX27的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道13为15AX30的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。图31为引物S11对应的RAPD条带图谱泳道1为单17-7-1的PCR结果,泳道2为15AX33的PCR结果,泳道3为15AX34的PCR结果,泳道4为15AX36的PCR结果,泳道5为15AX38的PCR结果,泳道6为15AX39的PCR结果,泳道7为Marker,泳道8为单17-7-1的PCR结果,泳道9为15JGS2的PCR结果,泳道10为15JGS4的PCR结果,泳道11为15JGS11的PCR结果,泳道12为15JGS35的PCR结果,泳道13为15JGS38的PCR结果,其中泳道7Marker条带按照分子量大小从上往下顺序依次为:10000bp,5000bp,3000bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp;泳道1为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道2为15AX33的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道3为15AX34的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道4为15AX36的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道5为15AX38的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道6为15AX39的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道8为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道9为15JGS2的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道10为15JGS4的RAPD条带大小估算为无;泳道11为15JGS11的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道12为15JGS35的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间;泳道13为15JGS38的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。图32为引物S11对应的RAPD条带图谱泳道1Marker,泳道2为单17-7-1的PCR结果,泳道3为15FY8的PCR结果,泳道4为15FY13的PCR结果,泳道5为15FY14的PCR结果,泳道6为15LQ4的PCR结果,泳道7为14DBS50的PCR结果,其中泳道1Marker条带按照分子量大小从上往下顺序依次为:10000bp,5000bp,3000bp,2000bp,1500bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp;泳道2为单17-7-1的RAPD条带大小估算为3000bp~2000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道3为15FY8的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道4为15FY13的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间;泳道5为15FY14的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间;泳道6为15LQ4的RAPD条带大小估算为2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,750bp~500bp之间;泳道7为14DBS50的RAPD条带大小估算为5000bp~3000bp之间,2000bp~1500bp之间,1500bp~1000bp之间,1000bp~750bp之间,750bp~500bp之间。具体实施方式以下实施例所用蝉花单17-7-1菌株于2009年11月18日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心简称CGMCC注册保藏,保藏号为CGMCCNo.3453;其他不同地域蝉花分别采集自安溪编号分别为:15AX22,15AX27,15AX30,15AX33,15AX34,15AX36,15AX38,15AX39、九江编号分别为:15JJ5,15JJ7,15JJ8,15JJ10,15JJ14,15JJ17,15JJ18、井冈山编号分别为:15JGS2,15JGS4,15JGS11,15JGS35,15JGS38、富阳编号分别为:15FY8,15FY13,15FY14、大别山编号为:14DBS50、乐清编号为:15LQ4;编号安徽繁昌IC407、江苏句容16JR41、16JR42、浙江安吉16AJ26,以上菌株均为蝉棒束孢。实施例1基于RAPD技术,先人工合成多个随机多态核苷酸序列作为引物,所述引物序列见表1。表1引物序列编号引物名称引物序列5'到3'SEQIDNO:1S11GTAGACCCGTSEQIDNO:2S6TGCTCTGCCCSEQIDNO:3S7GGTGACGCAGSEQIDNO:4S10CTGCTGGGACSEQIDNO:5S30GTGATCGCAGSEQIDNO:6S31CAATCGCCTGSEQIDNO:7S33CAGCACCCACSEQIDNO:8S37GACCGCTTGTSEQIDNO:9S46ACCTGAACGGSEQIDNO:10S61TTCGAGCCAGSEQIDNO:11S67GTCCCGACGASEQIDNO:12S92CAGCTCACGASEQIDNO:13S103AGACGTCCACSEQIDNO:14S136GGAGTACTGGSEQIDNO:15S140GGTCTAGAGGSEQIDNO:16S151GAGTCTCAGGSEQIDNO:17S216GGTGAACGCTSEQIDNO:18S219GTCCGTATGGSEQIDNO:19S9TGGGGGACTCSEQIDNO:20S12CCTTGACGCASEQIDNO:21S21CAGGCCCTTCSEQIDNO:22S34TCTGTGCTGGSEQIDNO:23S35TTCCGAACCCSEQIDNO:24S36AGCCAGCGAASEQIDNO:25S41ACCGCGAAGGSEQIDNO:26S42GGACCCAACC采用CTAB法提取蝉花单17-7-1和不同地域蝉花DNA,采用上述各引物进行聚合酶链式反应扩增,然后进行琼脂糖电泳,检测RAPD条带。其中PCR反应条件如下:反应体系:总体积50μL,DNA样本:50ng,dNTP:6nmol,引物:20pmol,Taq酶:2U,Buffer:5μL,加ddH2O至50μL。PCR反应条件:95℃5min;95℃40sec,38℃1min,72℃2min,共循环40次;72℃10min,4℃保存。1.2%琼脂糖凝胶电泳,电压100V40min;凝胶成像仪Alphamager拍摄。检测结果见图1-26。由电泳图可以看出,除引物S11图18外,其他引物的电泳图中不同地域蝉花与单17-7-1菌株都具有一条或者多条相同的电泳条带,还有个别引物PCR结果无条带。只有引物S11的电泳图中单17-7-1菌株在3000bp~2000bp之间具有一条独有的条带,而其他不同地域的蝉花并不具有,可以明显的区分蝉花单17-7-1与其他不同地域蝉花。实施例2以实施例1筛选得到的引物S11建立对蝉花单17-7-1的鉴定方法。RAPD指纹图谱稳定性实验1:试验操作:1.采用CTAB法提取同一批次蝉花单17-7-1和不同地域蝉花DNA,采用引物S11进行聚合酶链式反应扩增,然后进行琼脂糖电泳,检测RAPD条带。2.PCR反应条件如下:反应体系:总体积50μL,DNA样本:50ng,dNTP:6nmol,引物:20pmol,Taq酶:2U,Buffer:5μL,加ddH2O至50μL。PCR反应条件:95℃5min;95℃40sec,38℃1min,72℃2min,共循环40次;72℃10min,4℃保存。3.1.2%琼脂糖凝胶电泳,电压100V40min。4.凝胶成像仪Alphamager拍摄。实验结果:以S11为引物,对同一批次提取蝉花单17-7-1和不同地域蝉花的DNA为模板的PCR而获得的电泳图谱分别如图27、图28、图29所示。从电泳图谱上看,以同一批次抽提的DNA为模板,并重复3次,得到主要的扩增片段是一致的。从以上试验结果可以得出,RAPD检测DNA多态性是一种稳定的、可靠的方法。RAPD指纹图谱稳定性实验2:试验操作:1.CTAB法提取不同批次的蝉花单17-7-1和不同地域蝉花DNA,采用引物S11进行聚合酶链式反应扩增,然后进行琼脂糖电泳,检测RAPD条带。2.PCR反应条件如下:反应体系:总体积50μL,DNA样本:50ng,dNTP:6nmol,引物:20pmol,Taq酶:2U,Buffer:5μL,加ddH2O至50μL。PCR反应条件:95℃5min;95℃40sec,38℃1min,72℃2min,共循环40次;72℃10min,4℃保存。3.1.2%琼脂糖凝胶电泳,电压100V40min。4.凝胶成像仪Alphamager拍摄。实验结果:以S11为引物,对不同批次提取蝉花单17-7-1和不同地域蝉花的DNA为模板的PCR而获得的电泳图谱如图30、图31、图32所示。从电泳图谱上看,以不同批次抽提的DNA为模板,并重复3次,得到主要的扩增片段基本是一致的。从以上试验结果可以得出,RAPD检测不同样本DNA多态性是一种稳定的、可靠的方法。从中可见采用引物S11,可以明显的区分蝉花单17-7-1与其他不同地域蝉花的不同,因此利用RAPD分子标记技术并以引物S11作为鉴定蝉花单17-7-1的方法非常可行。序列表浙江泛亚生物医药股份有限公司一种蝉花菌株的RAPD分子标记鉴定方法26SIPOSequenceListing1.0110DNA人工序列ArtificialSequence1gtagacccgt10210DNA人工序列ArtificialSequence2tgctctgccc10310DNA人工序列ArtificialSequence3ggtgacgcag10410DNA人工序列ArtificialSequence4ctgctgggac10510DNA人工序列ArtificialSequence5gtgatcgcag10610DNA人工序列ArtificialSequence6caatcgcctg10710DNA人工序列ArtificialSequence7cagcacccac10810DNA人工序列ArtificialSequence8gaccgcttgt10910DNA人工序列ArtificialSequence9acctgaacgg101010DNA人工序列ArtificialSequence10ttcgagccag101110DNA人工序列ArtificialSequence11gtcccgacga101210DNA人工序列ArtificialSequence12cagctcacga101310DNA人工序列ArtificialSequence13agacgtccac101410DNA人工序列ArtificialSequence14ggagtactgg101510DNA人工序列ArtificialSequence15ggtctagagg101610DNA人工序列ArtificialSequence16gagtctcagg101710DNA人工序列ArtificialSequence17ggtgaacgct101810DNA人工序列ArtificialSequence18gtccgtatgg101910DNA人工序列ArtificialSequence19tgggggactc102010DNA人工序列ArtificialSequence20ccttgacgca102110DNA人工序列ArtificialSequence21caggcccttc102210DNA人工序列ArtificialSequence22tctgtgctgg102310DNA人工序列ArtificialSequence23ttccgaaccc102410DNA人工序列ArtificialSequence24agccagcgaa102510DNA人工序列ArtificialSequence25accgcgaagg102610DNA人工序列ArtificialSequence26ggacccaacc10

权利要求:1.一种蝉花单17-7-1菌株的鉴定方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:步骤1,提取待检测菌株的DNA;步骤2,对步骤1获得的待检测菌株DNA采用引物进行PCR扩增,引物序列为SEQIDNO:1;步骤3,将步骤2获得的扩增产物经琼脂糖凝胶电泳后获得待检测菌株的RAPD条带图谱;步骤4,将步骤3获得的待检测菌株RAPD图谱进行分析获得判定结果。2.如权利要求1所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤2所采用的PCR扩增反应体系为:总体积50μL,DNA样本:50ng,dNTP:6nmol,引物:20pmol,Taq酶:2U,Buffer:5μL,加ddH2O至50μL。3.如权利要求1所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤2所采用的PCR扩增反应条件如下:先95℃5分钟;然后依次95℃40秒,38℃1分钟,72℃2分钟,共循环40次;然后72℃延伸10分钟,最后降温至4℃保存。4.如权利要求1所述的鉴定方法,其特征在于,所述步骤4中,将步骤3获得的RAPD条带图谱进行分析,待检测菌株在3000bp~2000bp之间具有一条条带,鉴定待检测菌株为蝉花菌株单17-7-1菌株。

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