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心血管代谢共患病亚型的构建方法及其在心血管疾病风险预测中的应用 

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申请/专利权人:上海市内分泌代谢病研究所;深圳华大生命科学研究院

摘要:本发明公开了心血管代谢共患病亚型的构建方法及其在心血管疾病风险预测中的应用,基于21项生物标记物与表型指标,利用无监督聚类算法构建心血管代谢共患病亚型,包括收集样本的代谢生物标记物与代谢表型指标作为原始数据,同时收集社会人口学信息、生活方式、疾病史和用药史数据;原始数据进行预处理后,选取21项生物标记物与表型指标建模,采用无监督聚类算法确定最优的聚类亚型数量,构建得到代谢共患病亚型MC1、MC2、MC3、MC4、MC5,其应用于远期心血管疾病风险预测,MC1、MC2、MC3提示远期心血管疾病发病风险低,MC4、MC5提示远期心血管疾病发病风险高,代谢共患病亚型对心血管疾病风险具有良好预测作用。

主权项:1.心血管代谢共患病亚型的构建方法,其特征在于,基于21项生物标记物与表型指标,利用无监督聚类算法构建心血管代谢共患病亚型,包括以下步骤:步骤1:获取多个样本作为发现队列样本,收集样本的代谢生物标记物与代谢表型指标作为原始数据,同时收集社会人口学信息、生活方式、疾病史和用药史数据;步骤2:对步骤1获取的原始数据进行预处理,包括对数据进行整理和质量控制,选取8类指标共计21项生物标记物与表型指标建模,包括:第1类:肥胖指标,包括BMI、WC;第2类:血糖代谢指标,包括FPG、PPG、HbA1c;第3类:胰岛素代谢指标,包括Fins、Pins、HOMA-IR;第4类:血脂代谢指标,包括TC、LDL-C、HDL-C、TG、ApoA-1、ApoB;第5类:尿酸代谢指标,包括UA;第6类:肝功能指标,包括AST、ALT、GGT;第7类:肾功能指标,包括eGFR;第8类:血压指标,包括SBP、DBP;步骤3:基于所述21项生物标记物与表型指标,采用无监督聚类算法确定最优的聚类亚型数量,构建得到代谢共患病亚型,分别为MC1、MC2、MC3、MC4、MC5。

全文数据:

权利要求:

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