龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室)
摘要：本申请提出了一种基于HOST和FPGA协同的分子动力学非共价键计算方法及装置，包括以下步骤：HOST端基于分子结构构建模拟盒子并采用网格划分的方法将所述模拟盒子划分为多个相同大小的子格子；HOST将每一区域中的粒子数据信息传输给FPGA，FPGA基于每一粒子的数据信息进行非共价键的计算，并将计算结果传输给HOST进行整合完成非共价键的计算。本方案通过将HOST与FPGA进行协同计算粒子的非共价键作用力从而提高计算效率。
主权项：1.一种基于HOST和FPGA协同的分子动力学非共价键计算方法，其特征在于，包括：HOST端基于分子结构构建模拟盒子并采用网格划分的方法将所述模拟盒子划分为多个相同大小的子格子，基于分子结构中每一粒子的粒子数据信息构建粒子信息查找表存储于共享存储区域中，所述粒子数据信息包括粒子编号、粒子所属子格子、粒子所属子格子的子格子标识号、粒子的实时位置信息以及粒子的计算参数；设定含有粒子的子格子为主叫格子，每一主叫格子一半数量的相邻格子作为该主叫格子的计算区域，其中相邻格子为直接相邻主叫格子的子格子，HOST端通过PCIE接口将共享存储区域中的粒子信息查找表传输到FPGA中的HBM2存储设备中，FPGA基于接收到的粒子信息查找表中的粒子数据信息并行计算每一主叫格子与对应计算区域的作用力作为第一作用力结果，并将第一作用力结果缓存到所述共享存储区域中；当HOST端从共享存储区域中接收每一主叫格子的第一作用力结果后将其传输给FPGA，FPGA基于每一主叫格子的第一作用力结果计算每一主叫格子与对应对称区域的作用力作为第二作用力结果并将所述第二作用力结果传输到共享存储区域中，所述对称区域为与主叫格子的计算区域对称且与该主叫格子相邻的子格子组成的区域；HOST端基于共享存储区域中每一主叫格子的第一作用力结果和第二作用力结果更新分子结构中每一粒子的坐标信息完成非共价键计算。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 西湖实验室(生命科学和生物医学浙江省实验室) 基于HOST和FPGA协同的分子动力学非共价键计算方法及装置
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号