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一种具有MS2.2-crRNA结构的RNA编辑器及其制备方法和应用 

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申请/专利权人:上海交通大学重庆研究院

摘要:本发明涉及生物工程技术领域,本发明提供了一种具有MS2.2‑crRNA结构的RNA编辑器及其制备方法和应用。本发明通过对crRNA颈环结构进行改造,插入RNA适配子MS2;此设计可以用于MCPMS2介导的类病毒virus‑likeparticle的mRNA包装体系,用来包装和递送Cas13X.1crRNA复合体,进而进行RNA敲除和编辑。克服了通常的RNA适配子结构会影响Cas13X.1的切割RNA活性的问题,经过本发明修饰的MS2‑crRNA,仍然保留有大部分hfCas13X.1介导的RNA降解活性。

主权项:1.一种具有MS2.2-crRNA结构的RNA编辑器的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:1以CMV-hfCas13X.1-U6-crRNA质粒为模板,用引物组合C13X-U6-Spe1-F和MS2.2-13XDR-R13进行扩增,得到PCR产物;2以PCR产物作为模板,用引物组合C13X-U6-Spe1-F和Mlu1-13XDR-MS2.2-R2进行扩增,得到MS2.2-C13XDR片段;3将MS2.2-C13XDR片段进行酶切,回收得到酶切产物1;4将CMV-hfCas13X.1-U6-crRNA质粒进行酶切,回收得到酶切产物2;5将酶切产物1和酶切产物2进行连接,得到CMV-hfCas13X.1-U6-MS2.2-crRNA质粒;步骤1中所述CMV-hfCas13X.1-U6-crRNA质粒的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示;所述C13X-U6-Spe1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示;所述MS2.2-13XDR-R13的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示;步骤2中所述Mlu1-13XDR-MS2.2-R2的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示;步骤3中所述酶切所用的酶为SpeI和MluI内切酶;步骤4中所述酶切所用的酶为SpeI和MluI内切酶。

全文数据:

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