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基于人工智能的基因调控区编辑方法 

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申请/专利权人:华中农业大学;未米生物科技(海南)有限公司

摘要:本发明属于生物信息学领域,具体涉及一种基于人工智能的基因调控区编辑方法。本发明使用人工智能算法对启动子、5’‑UTR、3’‑UTR、终止子构成的基因调控区进行模拟突变,以衡量不同基因编辑方案对基因表达的影响,从而根据育种需求生成精准的基因编辑方案。

主权项:1.一种针对基因调控区的基因编辑方法,其特征在于:包括如下步骤:1基于目标基因近端调控区序列搭建基因表达量预测模型;2基于遮挡的可解释性算法计算调控区每个碱基的贡献度;3基于输入序列碱基的贡献度分数向量,设计寻峰算法,获得高贡献度碱基;4根据基因表达量调控目的在高贡献度碱基中选择需要编辑的碱基,如果需要调高基因表达量,则选择正贡献碱基;如果需要调低基因表达量,则选择负贡献碱基;5根据编辑碱基位置设计编辑靶标并开展基因编辑实验。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 华中农业大学 未米生物科技(海南)有限公司 基于人工智能的基因调控区编辑方法

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