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一种快速检测奶牛早期胚胎致死基因的方法、系统及其应用 

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申请/专利权人:山东奥克斯畜牧种业有限公司;山东省农业科学院畜牧兽医研究所

摘要:本发明属于基因检测和数据分析技术领域,具体涉及一种快速检测奶牛早期胚胎致死基因的方法、系统及其应用。具体的,本发明通过查找在活体动物中不存在纯合子的单倍型;然后评估风险交配携带者X携带者的单倍型效应。最后利用全基因组测序数据来查找检测与致死单倍型相关的点突变或结构变异。本发明仅通需要活体动物的基因组测序数据,而不需要其他表型数据,就可以直接检测个体的隐性致死性单倍型,从而判断和快速检测早期胚胎致死基因,避免良种公牛致死基因在牛群中传播和后代致死基因的大面积携带,因此具有良好的实际应用价值。

主权项:1.一种快速检测奶牛早期胚胎致死基因的方法,其特征在于,所述方法基于基因组芯片数据检测奶牛胚胎致死基因,具体包括:S1、基于两步法检测活体动物中缺失纯合子的单倍型,最终选择完全没有纯合子的单倍型作为隐性致死的标签单倍型;S2、评估风险交配携带者X携带者的单倍型效应;S3、利用全基因组测序数据来检测造成隐性致死性单倍型的遗传变异。

全文数据:

权利要求:

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