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申请/专利权人:中国科学院昆明植物研究所
摘要:本发明公开了一种鉴别翅果油树的方法,涉及植物分子鉴定技术领域,包括以下步骤:以待鉴定样本的基因组DNA为模板,进行PCR扩增并纯化,将获得的纯化扩增产物进行基因组浅层测序,获得GenomeSkimming数据,使用Fastp、Bowtie2、Consult软件对所述GenomeSkimming数据进行质量过滤,得到Cleandata,对Cleandata运行Skmer软件并估算两两基因组之间的Jaccard指数,构建物种聚类树,若待鉴定样本聚于Elaeagnusmollis的一个分支上,则鉴定为翅果油树。本发明的方法不同于使用DNA条形码的鉴定方法,利用未组装、未必对的基因组序列直接进行物种鉴定,避免了基因组组装过程中人为干扰和基因序列丢弃的问题,更快、更准确的鉴定翅果油树。
主权项:1.一种鉴别翅果油树的方法,其特征在于,包括以下步骤:以待鉴定样本的基因组DNA为模板,进行PCR扩增并纯化,将获得的纯化扩增产物进行基因组浅层测序,获得GenomeSkimming数据,使用Fastp、Bowtie2、Consult软件对所述GenomeSkimming数据进行质量过滤,得到Cleandata,对Cleandata运行Skmer软件并估算两两基因组之间的Jaccard指数,构建物种聚类树,若待鉴定样本聚于Elaeagnusmollis的一个分支上,则鉴定为翅果油树。
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权利要求:
百度查询: 中国科学院昆明植物研究所 一种鉴别翅果油树的方法
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