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申请/专利权人:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所(中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心)
摘要:本发明提供SIV、PRRSV与PVC3三重TaqMan荧光定量RT‑PCR检测方法,涉及荧光定量RT‑PCR检测方法技术领域。该SIV、PRRSV与PVC3三重TaqMan荧光定量RT‑PCR检测方法,具体包括以下步骤,S1.引物特异性检测,S2.单重荧光定量PCR反应条敏感性试验和标准曲线的建立,S3.多重荧光定量PCR反应体系和条件优化结果,S4.多重荧光定量PCR反应条特异性试验结果,S5.多重荧光定量PCR反应条敏感性试验结果,S6.多重荧光定量PCR反应条重复性试验结果,S7.多重荧光定量PCR的验证。通过采用以上方法,可为荧光定量RT‑PCR检测操作进行简化,解决了现有的荧光定量RT‑PCR检测方法虽然很多,但是操作复杂,无法满足于临床对该病的快速诊断要求,提升该方法使用时的检测速度,提升该方法的实用性。
主权项:1.SIV、PRRSV与PVC3三重TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法,其特征在于,具体包括以下步骤:S1.引物特异性检测以SIV,PCV3,PRRSV,CSFV,PRV,SS,HPS,PAM细胞基因组为模板,对三对引物和探针进行单重PCR扩增;S2.单重荧光定量PCR反应条敏感性试验和标准曲线的建立以不同稀释度的质粒作为模板,对三对引物和探针进行敏感性试验并建立标准曲线,建立的标准方程:SIVY=-3.244logx+38.609R2=0.994Eff%=103.345PRRSVY=-3.55logx+40.203R2=0.995Eff%=91.279PCV3Y=-3.338logx+37.501R2=0.994Eff%=99.35;S3.多重荧光定量PCR反应体系和条件优化结果为提高多重反应体系的性能,减少不同荧光之间的干扰,对引物浓度,探针浓度,退火温度等条件进行优化,以未出现非特异性扩增时循环数值小的条件为优先选择条件,出现近似数值时选择荧光强度高、引物和探针使用量少的条件,根据不同退火温度选择未出现显著差异的温度作为最终优化条件,退火温度设置为:52℃、54℃、56℃、58℃、60℃和62℃6个梯度,最终选择60℃退火,TanMan荧光定量PCR中引物探针固定为10μM,使用0.2-0.8μL引物,0.4-1.2μL探针以矩阵法进行交叉反应;S4.多重荧光定量PCR反应条特异性试验结果以SIVPRRSVPCV3CSFVPRVSSHPSPAM细胞基因组为模板,在优化好的条件,对三对引物和探针进行多重荧光定量PCR扩增;S5.多重荧光定量PCR反应条敏感性试验结果将构建好的三个阳性质粒标准品均稀释到108copiesμL放入一个200μL混合体系中,然后进行10倍倍比稀释,以108copiesμL为初始浓度稀释到101copiesμL,同时以ddH2O为阴性对照,进行三重荧光定量PCR扩增反应,用于确定该方法的敏感性;S6.多重荧光定量PCR反应条重复性试验结果对103-106稀释的质粒拷贝数进行重复性试验,计算平均值以及标准差,批间和批内试验的变异系数小于5%,证明方法重复性较好;S7.多重荧光定量PCR的验证用于本实验所建立的TaqMan多重荧光定量PCR检测方法对110份临床样本进行了检测,以验证其在临床应用中的性能,为了进行验证,所有样本都进一步通过常规PCR和测序进行了鉴定。
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