买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

申请/专利权人：郑州大学

摘要：本发明涉及植物非生物胁迫响应技术领域，具体涉及一种超级芦竹耐水淹分子特征的研究方法，以郑州大学农学院培育的超级芦竹为实验材料，进行为期45Zd的水淹胁迫处理，通过对芦竹根系和叶片的形态解剖观察、生理生化指标测定和转录组学分析，挖掘芦竹耐水淹的调控通路和关键基因，探索芦竹响应水淹胁迫的转录调控机制，首次对水淹胁迫条件下芦竹差异表达基因进行了挖掘和分析，为研究芦竹响应水胁迫的机制及耐淹基因奠定了基础，为芦竹的生产实践和丰富耐水淹理论具有重要的意义，并为后续的耐淹植物筛选和芦竹应用于湿地保护、园林绿化、污水处理和生态修复等方面提供参考。

主权项：1.一种超级芦竹耐水淹分子特征的研究方法，其特征在于：包括以下步骤：S1、选取大小一致、长势良好且带有腋芽的芦竹，逐节切割成长15cm的带有腋芽的芦竹茎段,然后将各芦竹茎段种植于试验盆中进行预培养；S2、预培育6个月后，选取生长状况良好且长势一致的芦竹进行水淹实验，随机分为水淹处理组和对照组，每组处理重复三次，每个重复9盆植株；S3、实验开始后，分别在水淹处理的第0d、5d、15d、30d和45d测定芦竹茎段的株高、叶长、叶宽和叶面积；S4、在水淹处理的设定天数，随机选取水淹处理组和对照组的芦竹水面以下茎部节间的新生不定根进行石蜡切片，番红固绿染色观察通气组织结构变化，4'，6-二脒基-2-苯基吲哚荧光染色检测芦竹根部细胞核的形态变化；S5、在水淹处理的设定天数，随机选取水淹处理组和对照组的芦竹的根系进行二氨基联苯胺四盐酸盐染色和氮蓝四唑染色，进而评价活性氧在芦竹根部积累；同时，随机选取水淹处理组和对照组的芦竹茎段测定叶片和根系的生理生化指标；S6、在水淹处理的第30d、45d，提取水淹处理组和对照组的芦竹的芦竹根RNA、芦竹叶RNA，构建cDNA文库；S7、对所述的cDNA文库进行转录组分析，获得高质量的序列信息；S8、将所述的序列信息进行从头组装，优化过滤后，将所得的Cleanreads与Trinity组装获得的组装序列进行比对，进行后续转录组学分析；S9、使用Diamond将获得的所有转录本与分别与GO、KEGG、COG、Pfam、NR和Swiss-Prot数据库进行比对，得到注释结果，并对各数据库注释情况进行统计；S10、使用DESeq2进行样本间差异表达基因Differentiallyexpressedgenes，DEGs的鉴定，|log2FC|≥1且p0.05的DEGs被认为是显著差异表达基因，得到芦竹根、芦竹叶差异表达基因；S11、使用Goatools和KOBAS对芦竹根、芦竹叶差异表达基因进行GO和KEGGPATHWAY富集分析，显著富集标准为p值≤0.05时；S12、通过定位到基因组区域的Cleanreads的Readscounts来计算基因的表达水平；使用RSEM对基因的表达水平进行定量分析；S13、根据比较转录组测序结果，从筛选到的芦竹根、芦竹叶差异表达基因中随机选择9个基因，以AdActin为内参基因，设计得到相应引物组。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 郑州大学 一种超级芦竹耐水淹分子特征的研究方法