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申请/专利权人：赛纳生物科技(北京)有限公司
摘要：本发明公开一种简并测序中用于鉴定核酸样品来源的索引序列集的设计方法，以及索引序列集的索引序列。本发明的设计方法要求索引序列集中的任意两条索引序列彼此可区分，即任意两条索引序列的用M、K表示的简并碱基序列不同且用R、Y表示的简并碱基序列不同且用W、S表示的简并碱基序列不同，本方法适应了简并测序的测序原理，能够保证利用不同的简并底物对多个核酸样品进行测序时，可以将不同的样品准确区分开。
主权项：1.一种对称索引序列集的设计方法，其特征在于：所述对称索引序列集用于在简并测序中鉴定目标多核苷酸的来源；所述索引序列集是由索引序列为元素构成的集合；所述简并测序指的是3’端不封闭的测序反应；简并测序中，包括两种不同的测序试剂：第一测序试剂和第二测序试剂；两种测序试剂循环加入；其中所述第一测序试剂包含具有可检测标记的两种不同的核苷酸单体；其中所述第二测序试剂包含具有可检测标记的与第一测序试剂不同的两种核苷酸单体，并且其中所述第二测序试剂是在提供了所述第一测序试剂随后提供的，将所述核苷酸单体掺入所述多核苷酸之后检测所述可检测标记生成的信号；所述对称索引序列集中，任意两条索引序列是可区分的，所述可区分的指的是索引序列的MK序列不同且RY序列不同且WS序列不同；所述MK序列指的是使用字母M、K表示的简并碱基序列，RY序列指的是使用字母R、Y表示的简并碱基序列，WS序列指的是使用字母W、S表示的简并碱基序列；通过枚举法获得低阶对称索引序列集，再以所述低阶对称索引序列集为基础通过直积法或陪集合并扩展法得到高阶对称索引序列集，所述高阶对称索引序列集中的索引序列的长度为5~20nt；所述陪集合并扩展法包括：获得两个完全不同的同阶对称索引序列集，将所述两个同阶对称索引序列集中的索引序列在指定位置各添加一个特定的碱基，合并后得到一个高阶对称索引序列集；所述完全不同指的是两个索引序列集没有公共索引序列，阶指的是索引序列集中索引序列的长度。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 赛纳生物科技(北京)有限公司 简并测序的索引序列集的设计方法
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