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申请/专利权人：广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所
摘要：本发明公开了一种过滤核苷酸多序列比对矩阵中低质量序列的方法，包括：基于R语言编写了5个函数，分别为revComplement函数、alignmentLength函数、anyShortseq函数、degap函数、maskSegment函数；revComplement函数用于纠正矩阵中反向互补序列；alignmentLength函数用于筛选符合长度阈值的矩阵；anyShortseq函数用于删除矩阵中存在的短序列；degap函数用于删除矩阵中缺失达到预设阈值的列；maskSegment函数用于屏蔽矩阵中高度变异、比对不可靠的片段。
主权项：1.一种过滤核苷酸多序列比对矩阵中低质量序列的方法，其特征在于，包括：获取核苷酸多序列比对矩阵，对核苷酸多序列比对矩阵筛选出需要反向互补序列，符合长度阈值的矩阵，矩阵中存在的短序列，矩阵中有缺失的列，高度变异比对不可靠的序列这五种低质量序列；对这五种低质量序列进行过滤。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所 一种过滤核苷酸多序列比对矩阵中低质量序列的方法
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