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申请/专利权人：中国地质大学(武汉)
摘要：本发明公开一种单细胞转录组测序数据的填充方法、存储介质、设备，涉及生物信息分析技术领域，方法包括：基于单细胞转录组的基因表达矩阵的k均值聚类结果中每个类的基因表达，求每个类的基因表达的期望，得到初始填充矩阵；基于基因表达矩阵得到细胞和基因的相似性矩阵，并构建图正则化非负矩阵分解的目标函数，设计迭代更新规则；通过迭代更新规则迭代后的细胞和基因的相似性矩阵，得到迭代后的填充矩阵；将迭代后的填充矩阵的每个元素与设定的阈值比较，得到元素为0或1的目标矩阵；将迭代后的填充矩阵为0且目标矩阵为1的元素标注为技术零值，得到最终填充矩阵。本发明可以准确的识别出真实的细胞表达，并对真实的数据进行填充。
主权项：1.一种单细胞转录组测序数据的填充方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、获取单细胞转录组基因表达的原始矩阵，将原始矩阵进行预处理，得到预处理矩阵；S2、基于预处理矩阵对细胞进行k均值聚类，根据聚类结果中每个类的基因表达，求每个类的基因表达的期望，得到初始填充矩阵；基于预处理矩阵得到细胞的相似性矩阵和基因的相似性矩阵；S3、根据初始填充矩阵、细胞的相似性矩阵和基因的相似性矩阵构建图正则化非负矩阵分解的目标函数，设计细胞的相似性矩阵和基因的相似性矩阵的迭代更新规则求解目标函数的局部最优解；S4、通过迭代更新规则迭代后的细胞的相似性矩阵和基因的相似性矩阵，得到迭代后的填充矩阵；S5、将迭代后的填充矩阵的每个元素与设定的阈值比较，得到元素为O或1的目标矩阵；S6、将迭代后的填充矩阵与目标矩阵对比，将迭代后的填充矩阵为0且目标矩阵为1的元素标注为技术零值，迭代后的填充矩阵其他元素保留原值，得到最终填充矩阵。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国地质大学(武汉) 一种单细胞转录组测序数据的填充方法、存储介质、设备
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