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一种疾病生物标志物发掘方法、系统及介质 

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申请/专利权人:苏州大学

摘要:本申请公开了一种疾病生物标志物发掘方法、系统及介质,该疾病生物标志物发掘方法包括以下步骤:基于多种生物信息学工具进行大范围的总蛋白库筛选,得到较大范围的筛选结果;基于GDAS系统程序进行筛选结果分析,筛选得到显著变化的糖蛋白列表;基于糖蛋白列表计算蛋白质组的不同糖肽的比例,并缩小蛋白质数据库范围;基于缩小范围后的蛋白质数据库分析查找疾病中的糖基化类型变化信息,得到靶糖蛋白质;针对筛选出的靶糖蛋白质进行结构解析,得到解析结果;通过对多种生物信息学工具的综合运用,筛选出临床之中与研究之中的潜在的生物标志物,提高筛选的效率和特异性。

主权项:1.一种疾病生物标志物发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,基于多种生物信息学工具进行大范围的总蛋白库筛选,得到较大范围的糖蛋白筛选结果;S2,使用GDAS系统程序,该程序基于Python语言进行开发,设置不同的运行模式,通过对其他生物信息学工具的输出结果进行筛选和结果分析,筛选得到显著变化的糖蛋白列表;S3,基于糖蛋白列表计算蛋白质组的不同糖肽的含量比例,并缩小糖蛋白质数据库范围;S4,基于缩小范围后的糖蛋白质数据库分析查找疾病中的糖基化类型变化信息,得到靶糖蛋白质;S5,针对筛选出的靶糖蛋白质进行结构解析,得到解析结果。

全文数据:

权利要求:

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