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申请/专利权人：国科大杭州高等研究院
摘要：本发明公开了一种piRNA的分析方法，包括步骤1‑7，本发明针对原始的anti‑MIWIRIP‑seq数据集进行分析即可得到全面而理想的分析结果，无需通过实验手段对piRNA样品进行其他的处理操作，这为生殖领域和RNA领域开展piRNA加尾修饰研究提供了一种有力的生物信息学分析工具。
主权项：1.一种piRNA的分析方法，其特征在于，包括以下步骤：1、将小RNA的测序reads与参考基因组进行比对；2、将1中成功比对的reads进一步与pre-miRNA参考序列比对；对成功比对miRNA的测序reads，通过不同样本miRNA比对reads数量计算标准化参数；3、对2中未成功比对miRNA的reads去除其他小RNA的污染后与piRNA参考序列比对；4、对3中能完全匹配的reads定义为未加尾piRNA，用步骤2中的标准化参数进行标准化；5、步骤1中未比对成功的reads定义为加尾piRNA，去除其3'末端1nt碱基，然后重复步骤1-3；得到加尾1nt的piRNA；6、将5中未与参考基因组成功比对的reads再去除3'末端1nt碱基，然后重复步骤1-3；得到加尾2nt的piRNA；7、按照5和6中的方式进行迭代直至无法获得新加尾的piRNA；然后将所有加尾的piRNA合并并用步骤2的标准化参数进行标准化。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 国科大杭州高等研究院 一种piRNA的分析方法
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