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申请/专利权人：西安理工大学

摘要：本发明提供了一种基于自监督学习的piRNA与疾病关联关系的识别方法，包括以下步骤：步骤1，构建piRNA与疾病关联关系识别研究的基准数据集；步骤2，计算多维度piRNA相似性和疾病相似性；步骤3，创建基于多视图的特征矩阵；步骤4，构建一种基于自监督学习的piRNA与疾病关联关系的识别模型，获取关联关系识别分数；步骤5，利用步骤S4得到的识别分数，详细分析和量化piRNA与疾病之间是否存在边的关系，以便识别piRNA与疾病的关联关系。本发明用于识别piRNA与疾病关联关系，它基于三个公开数据库构建可靠数据集，并计算相似性创建多视图特征矩阵；在模型识别中，采用奇异值分解优化结点间的关系、组合增广策略保留关键信息以及KAN网络令后续分类结果更为可靠和可信。

主权项：1.一种基于自监督学习的piRNA与疾病关联关系的识别方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤S1：构建piRNA与疾病关联关系识别研究的基准数据集；步骤S2：计算多维度piRNA相似性和疾病相似性；步骤S3：创建基于多视图的特征矩阵；步骤S4：构建一种基于自监督学习的piRNA与疾病关联关系的识别模型，获取关联关系识别分数；步骤S5：利用步骤S4得到的识别分数，详细分析和量化piRNA与疾病之间是否存在边的关系，以便识别piRNA与疾病的关联关系；其中，所述步骤S1具体包括：步骤S11：根据MeSH数据库中疾病ID，针对piRDisease、pirpheno和MNDR三个公开数据库中的疾病表述数据，标准化疾病名称，确保疾病名称的一致性和唯一性；步骤S12：根据piRBase数据库中piRNAID和序列，统一三个公开数据库中的piRNA标识符，确保piRNA的一致性和唯一性；步骤S13：合并三个公开数据库中的piRNA与疾病关联数据，确保每对piRNA与疾病关联都被包括在内；对关联关系进行去重清洗，确保每对piRNA与疾病关联在最终数据集中唯一存在；其中，所述步骤S4具体包括：步骤S41：根据步骤S13获得的piRNA与疾病关联矩阵，通过奇异值分解技术对关联矩阵进行分解，重构SVD视图，并与原始视图进行对比，得到重构后的矩阵和原始矩阵；步骤S42：将得到的原始矩阵和重构的矩阵进行数据增强操作；步骤S43：对数据增强后的两个矩阵作为嵌入初始矩阵，分别输入到两个共享权重的轻量图卷积网络编码器进行特征提取；步骤S44：利用提取后的两个特征矩阵，分别通过两个KAN网络进行特征映射，得到两个映射矩阵；步骤S45：基于映射矩阵计算对称归一化温度交叉熵损失函数及均方误差优化图结构。

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