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申请/专利权人:中山大学
摘要:本发明公开了一种抗生素耐药性在无抗生素环境下可逆性的预测方法,包括以下步骤:1构建包含野生型耐药基因和耐药基因突变体的等位基因文库;2将所述等位基因文库与无功能对照菌混合后在有和无抗生素环境下进行竞争性培养,计算野生型耐药基因和耐药基因突变体相对于无功能对照菌的相对生长速率;根据相对生长速率将耐药基因突变体进行分型,所述分型包括在无抗生素环境下分为无适应度代价、适应度代价下降或适应度代价增加,在有抗生素环境下分为没有抗性、抗性降低或抗性增强;4若耐药基因具有高适应度代价且无适应度代价的抗性耐药基因突变体在其近端突变体中罕见,则判定该耐药基因在无抗生素环境下具有可逆性。实施本发明,可以高效预测抗生素耐药性在无抗生素环境下的可逆性。
主权项:1.一种抗生素耐药性在无抗生素环境下可逆性的预测方法,其特征在于,包括以下步骤:1构建耐药基因的等位基因文库,所述等位基因文库包含野生型耐药基因和耐药基因突变体;2将所述等位基因文库与无功能对照菌混合后在有和无抗生素环境下进行竞争性培养,计算野生型耐药基因和耐药基因突变体相对于无功能对照菌的相对生长速率;3根据相对生长速率将耐药基因突变体进行分型,所述分型包括在无抗生素环境下分为无适应度代价、适应度代价下降或适应度代价增加,在抗生素环境下分为没有抗性、抗性降低或抗性增强;4若耐药基因具有高适应度代价,且无适应度代价的抗性耐药基因突变体在其近端突变体中罕见,则判定该耐药基因在无抗生素环境下具有可逆性。
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权利要求:
百度查询: 中山大学 抗生素耐药性在无抗生素环境下可逆性的预测方法及其应用
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