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申请/专利权人:世华医学科技(苏州)有限公司
摘要:本发明公开了一种构建杂交捕获测序文库的方法。所述方法包括以下步骤:1文库混合,按公式1计算子文库的体积,将子文库进行混合,得到混合文库;2文库杂交捕获,对所述混合文库进行纯化,并与杂交反应液混合进行预反应,加入捕获反应液进行捕获反应,进行洗脱及扩增,得到所述杂交捕获测序文库;本发明采用独特的杂交前文库混合策略,拓展杂交前文库混合方法的适用性,降低子文库质量、片段大小差异对预期数据产出的影响,提供了一种捕获效率高效、捕获均衡性好、操作简单且适应性广的杂交捕获方法。
主权项:1.一种构建杂交捕获测序文库的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:1文库混合按公式1计算子文库的体积,将子文库进行混合,得到混合文库,其中,Vn代表第n个子文库的体积,单位为μL;M代表混合文库质量,单位为ng;Fn代表第n个子文库的片段大小,单位为bp;Cn代表第n个子文库的质量浓度,单位为ngμL;Dn%代表第n个子文库的校正数据量占比,计算公式为公式2,Dn代表第n个子文库的数据量,单位为Gb,Rn代表第n个子文库的数据量校正系数,cfDNA和gDNA类子文库的R=1,片段主峰大小1000bp的FFPE类子文库的R=2,片段主峰大小为500~1000bp的FFPE类子文库的R=3,片段主峰大小<500bp的FFPE类子文库的R=4; 2文库杂交捕获对所述混合文库进行纯化,并与杂交反应液混合进行预反应,加入捕获反应液进行捕获反应,进行洗脱及扩增,得到所述杂交捕获测序文库;步骤2所述纯化包括以下步骤:1’将所述混合文库与重复区域封阻序列混合;2’25~30℃孵育纯化磁珠20~30min,并加入步骤1’混合液中,25~30℃孵育5~15min;3’收集纯化磁珠,并使用80%酒精洗涤,进行干燥处理。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 世华医学科技(苏州)有限公司 一种构建杂交捕获测序文库的方法
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