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用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法、系统、电子设备及存储介质 

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申请/专利权人:济南大学

摘要:本发明属于生物信息结合深度学习的技术领域,更具体地,涉及一种用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法、系统、电子设备及存储介质。所述方法包括:对PDBbind数据集中的蛋白‑配体复合物样本进行预处理,构建训练样本集;构建亲和力预测模型,并利用训练样本集训练亲和力预测模型;分别获取蛋白和配体的pdb格式或pdbqt格式的结构文件,通过AutoDock分子对接进行蛋白和配体对接,得到目标蛋白‑配体复合物,并对目标蛋白‑配体复合物进行预处理;将预处理后的目标蛋白‑配体复合物输入训练后的亲和力预测模型中,生成蛋白‑配体亲和力预测结果。本发明提高了蛋白‑配体亲和力预测的精度和效率。

主权项:1.一种用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法,其特征在于,所述方法包括:S1、获取PDBbind数据集,并对所述PDBbind数据集中的蛋白-配体复合物样本进行预处理,构建训练样本集;S2、构建亲和力预测模型,并利用所述训练样本集训练所述亲和力预测模型;S3、分别获取蛋白质和配体的pdb格式或pdbqt格式的结构文件,通过AutoDock分子对接进行蛋白质和配体对接,得到目标蛋白-配体复合物,并对所述目标蛋白-配体复合物进行预处理;S4、将预处理后的所述目标蛋白-配体复合物输入训练后的所述亲和力预测模型中,生成蛋白-配体亲和力预测结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 济南大学 用于虚拟筛选的蛋白配体亲和力预测方法、系统、电子设备及存储介质

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