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申请/专利权人：齐鲁工业大学(山东省科学院)

摘要：本发明属于蛋白检测技术领域，具体涉及一种筛选高性能给体‑受体型β淀粉样蛋白荧光探针的方法和系统。本发明构建了给体‑受体型荧光探针‑β淀粉样蛋白复合物；并获取所有的复合物构象。对所有的复合物构象进行聚类分析，统计荧光探针在蛋白中的对接位点、相互作用能以及结合自由能信息；基于相互作用能以及结合自由能的结果筛选亲和力强的复合物构象。对筛选出的复合物构象中的荧光探针结构进行结构优化，获得结构稳定的荧光探针，从优化的结果中获取分子轨道能量参数；并计算获取结构优化后的荧光探针的光学性质参数，综合、全面地考察荧光探针的亲和力以及光学响应，筛选出高性能给体‑受体型β淀粉样蛋白荧光探针。

主权项：1.一种筛选高性能给体-受体型β淀粉样蛋白荧光探针的方法，其特征在于，包括：构建给体-受体型荧光探针分子模型，并与β淀粉样蛋白结构对接，构建给体-受体型荧光探针-β淀粉样蛋白复合物；并获取复合物构象；对复合物构象进行聚类分析，基于聚类分析结果进行复合物构象的筛选；对筛选出的复合物构象中的荧光探针结构进行结构优化，从优化的结果中获取分子轨道能量参数；并获取结构优化后的荧光探针的光学性质参数；基于获取的聚类分析结果、分子轨道能量参数以及光学性质参数筛选出高性能给体-受体型β淀粉样蛋白荧光探针；给体-受体型荧光探针分子模型与β淀粉样蛋白结构对接模拟的软件为AutoDock4.2，对接方法为半柔性对接，并选择LamrckianGA4.2算法执行对接；对复合物构象进行聚类分析，统计荧光探针在蛋白中的对接位点、相互作用能以及结合自由能信息；基于荧光探针在蛋白中的对接位点获取荧光探针对接到蛋白不同对接位点上的构象数占总对接构象数的比例p1；从优化的结果中获取分子轨道能量参数，所述分子轨道能量参数为最高占据轨道HOMO与最低未占据轨道LUMO之间的能隙p2；所述光学性质包括光吸收性质和荧光性质，所述参数具体包括吸收波长、荧光波长、荧光强度p3以及吸收波长和荧光波长之差Stokes位移p4；基于获取的聚类分析结果、分子轨道能量参数以及光学性质参数筛选出高性能给体-受体型β淀粉样蛋白荧光探针的方法包括：计算荧光探针对接到蛋白上的每一个对接位点处的构象数占总对接构象数的比例p1、最高占据轨道HOMO与最低未占据轨道LUMO之间的能隙p2的倒数、荧光强度p3以及吸收波长和荧光波长之差Stokes位移p4乘积，即p1××p3×p4；后计算该荧光探针对接到蛋白上的所有对接位点处的p1××p3×p4之和，即Σp1××p3×p4，Σp1××p3×p4值最大的荧光探针即为筛选出的性能最优探针。

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