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申请/专利权人：江南大学
摘要：本发明涉及一种基于构象动力学设计提高酶稳定性和活性的方法，属于计算化学，生物信息学，基因工程以及蛋白质工程技术领域。该方法包括以下步骤：基于高压分子动力学模拟的等温压缩系数扰动筛选出与酶的性质和功能密切相关的高可塑性区域，然后对高可塑性区域的氨基酸进行动态柔性指数和动态耦合指数计算，筛选出高稳定性和活性的突变体。本发明实现了从区域到点的筛选，克服了现有技术实用性不强的问题，并且同时提高了酶的稳定性和活性，提高了酶在工业上的应用价值。
主权项：1.一种基于构象动力学改造酶的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、通过高压分子动力学模拟的等温压缩系数扰动筛选出位于蛋白质表面远离活性中心的高可塑性区域；S2、计算高可塑性区域上氨基酸的动态柔性指数和动态耦合指数，设定阈值筛选出待定氨基酸位点；S3、对筛选出的氨基酸位点进行突变，得到改造后的酶；所述的动态柔性指数DFIi的计算公式为：，其中，i为目标氨基酸，j为蛋白质体系中的某一氨基酸，N为蛋白质体系中氨基酸的数量，为在j处各个方向上的扰动平均引起i处的波动响应大小，，为残基j扰动时残基i的位移变化；所述的动态耦合指数DCIi计算公式为：，其中，i为目标氨基酸，j为蛋白质体系中的某一氨基酸，N为蛋白质体系中氨基酸的数量，Nfunctional为活性中心氨基酸的数量，为在j处各个方向上的扰动平均引起i处的波动响应大小，，为残基j扰动时残基i的位移变化。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 江南大学 一种基于构象动力学设计提高酶稳定性和活性的方法
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