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申请/专利权人:四川农业大学
摘要:本发明涉及一种基于sdh酶染色的猪肌纤维图像自动识别与分割方法,属于细胞图像信息提取技术领域。包括S1、样本采集;S2、样本染色;S3、人工标注;S4、构建神经网络模型;S5、模型训练;S6、检测。本发明解决了常规深度学习方法对于大尺寸且肌纤维数量巨大500‑5000的肌纤维染色图像识别及分割困难的问题,有效提高了识别精度,并降低了计算消耗的存储,显著增加了利用机器代替人工自动分割肌纤维的实用性,有助于下游对肌纤维表型形成机制的研究。
主权项:1.基于sdh酶染色的猪肌纤维图像自动识别与分割方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、样本采集采集满足形态完整要求的肌纤维组织,并将该肌纤维组织按照设定的标准进行一次切割,并对一次切割后的肌纤维组织进行冷冻处理;S2、样本染色在恒温环境中对步骤S1冷冻得到的肌纤维组织进行二次切割,并利用SDH溶液对二次切割后的肌纤维组织进行染色,通过电子显微镜观察并拍摄,保存染色后的图像作为肌纤维样本图像;S3、人工标注利用图像重叠分割技术、超大图像数据集上预训练的分割模型、多边形矫正以及轮廓融合算法对骨骼肌酶染色图像进行I型肌纤维轮廓的标注,作为神经网络的训练、测试数据集;S4、构建神经网络模型利用数据扩增模块、基于带跳跃链接神经网络的特征提取模块、多尺度特征融合模块、边框提议模块、边框矫正模块、轮廓预测模块以及性能评估模块搭建完整的神经网络模型;S5、模型训练在扩增后的标注图像数据集上进行模型训练,通过优化目标函数来更新神经网络参数,并且采用动量训练策略;S6、检测结合滑动自适应窗口对图像进行重叠分割再放缩到统一尺寸,以增大单根肌纤维所占的图像比例及像素点数量,对分割图块进行检测后再融合轮廓数据,以提高检测精度并降低显存消耗。
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权利要求:
百度查询: 四川农业大学 基于sdh酶染色的猪肌纤维图像自动识别与分割方法
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