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申请/专利权人：墨卓生物科技(浙江)有限公司

摘要：本说明书实施例公开了一种fastq文件的测序数据拆分方法。本说明书实施例的方法包括：接收并解析fastq文件，获得包含依次排序的barcode1序列、W1序列、barcode2序列、UMI序列、PolyT序列TSO序列的read1数据；依次从read1数据中定位W1序列、barcode2序列、UMI序列、PolyT序列TSO序列在read1数据中的位置信息和序列结构；获取read1数据的前10bp序列为barcode1序列的节选序列，进行白名单匹配；将barcode2序列与白名单匹配，当上述两个序列均匹配成功时，该read1数据为有效read1数据。

主权项：1.一种fastq文件的测序数据拆分方法，其特征在于，包括：接收并解析fastq文件，获得包含依次排序的barcode1序列、W1序列、barcode2序列和UMI序列的read1数据；根据W1序列出现的位置范围，从read1数据中定位到W1序列在read1数据中的位置信息和序列结构；基于W1序列在read1数据中的位置信息、barcode2序列的基因长度、UMI序列的基因长度、PolyT序列的基因长度TSO序列的基因长度，依次确定barcode2序列、UMI序列、PolyT序列TSO序列在read1数据中的位置信息和序列结构；获取read1数据中前10bp的序列，并将其作为barcode1序列的节选序列；在节选序列后拼接与该节选序列相同的序列，形成barcode1序列的第一匹配序列；利用滑窗算法从第一匹配序列中提取一定基因长度的第一滑窗序列，将第一滑窗序列与第一barcode白名单进行匹配；在barcode2序列后拼接与该序列相同的序列，形成barcode2序列的第二匹配序列；利用滑窗算法从第二匹配序列中提取一定基因长度的第二滑窗序列，将第二滑窗序列与第二barcode名单进行匹配；当第一滑窗序列与第一barcode白名单匹配成功，且第二滑窗序列与第二barcode白名单匹配成功时，将read1数据确定为有效read1数据，否则，继续获取新的滑窗序列，进行barcode白名单匹配，若所有滑窗序列均与barcode白名单不匹配，将read1数据确定为无效read1数据；其中，所述第一barcode白名单和所述第二barcode白名单均包括若干拼接序列，每个拼接序列在原始白名单序列后拼接相同序列形成;所述fastq文件为单细胞平台下机输出的3’RNA数据或5’RNA数据的fastq文件，该fastq文件内的3’RNA数据或5’RNA数据包括依序相连的barcode1序列、W1序列、barcode2序列。

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