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申请/专利权人：重庆邮电大学
摘要：本发明属于医疗数据分析领域，涉及一种基于细胞死亡模式的癌症分型方法，包括：获取目标癌症对象的scRNA‑seq数据并进行预处理；从预处理后的数据中获取线粒体功能相关基因集，评估每个细胞类群的线粒体功能活性状态，得到差异活性基因；获取目标癌症对象的RNA‑seq数据，确定每个癌症患者的线粒体功能活性评分；获取PCD机制相关基因表达数据，识别与线粒体功能活性评分相关的PCD基因；基于正常与肿瘤样本识别差异基因与差异活性基因以及PCD基因进行交集筛选，得到关键基因；从关键基因中筛选候选基因；将候选基因输入到综合机器学习模型中，得到细胞死亡特征；根据细胞死亡特征对目标癌症进行分型；本发明能够探索癌症中线粒体功能与PCD机制之间的联系。
主权项：1.一种基于细胞死亡模式的癌症分型方法，其特征在于，包括：获取目标癌症对象的scRNA-seq数据，对scRNA-seq数据进行预处理；从预处理后的scRNA-seq数据中获取线粒体功能相关基因集，根据线粒体功能相关基因集评估每个细胞类群的线粒体功能活性状态，根据线粒体功能活性状态得到差异活性基因；获取目标癌症对象的RNA-seq数据，根据差异活性基因确定每个癌症患者的线粒体功能活性评分；获取PCD机制相关基因表达数据，识别与线粒体功能活性评分最相关的PCD基因；基于目标癌症的正常与肿瘤样本识别差异基因，并与差异活性基因以及PCD基因进行交集筛选，最终得到关键基因；对关键基因进行进一步的筛选，得到候选基因；将候选基因输入到综合机器学习模型中，得到细胞死亡特征；根据细胞死亡特征对目标癌症进行分型；根据癌症分型结果进行关键特征的鉴定与分析。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 重庆邮电大学 一种基于细胞死亡模式的癌症分型方法
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