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申请/专利权人:中国海洋大学
摘要:本发明提供了一种靶向挖掘乳酸菌蛋白质资源的方法,涉及蛋白质基因组数据分析技术领域。本发明通过全基因组学技术,利用高通量测序技术对乳酸菌基因组进行全面测序和分析;然后提取乳酸菌的胞壁蛋白酶和胞外蛋白酶,采用FASP法水解,对各多肽组分进行质谱鉴定,获得原始数据;利用软件对所述原始数据进行分析,获得下机数据;将下机数据与数据库中乳酸菌已知的所有蛋白的氨基酸序列进行比对,鉴定出蛋白质的种类和序列。本发明将全基因组学和蛋白组学进行结合,不仅能够快速、准确地分析乳酸菌蛋白质资源,提高挖掘的效率和准确性,还全面揭示了乳酸菌蛋白质的分布和功能特性,为后续的深入研究提供基础。
主权项:1.一种靶向挖掘乳酸菌蛋白质资源的方法,其特征在于,包括以下步骤:1提取乳酸菌的DNA,对乳酸菌进行全基因组测序;2通过生物信息学方法预测乳酸菌含有的蛋白,并获取预测蛋白的氨基酸序列;3提取乳酸菌的胞壁蛋白酶和胞外蛋白酶,采用FASP法水解蛋白质,酶解后进行脱盐,分别获得胞壁蛋白酶和胞外蛋白酶水解后的多肽;4利用液相色谱预分离各多肽组分,对各多肽组分进行质谱鉴定,获得原始数据;5利用鉴定和定量分析多肽和蛋白质的软件对所述原始数据进行分析,获得下机数据;6将下机数据与数据库中乳酸菌已知的所有蛋白的氨基酸序列进行比对,鉴定出蛋白质的种类和序列。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国海洋大学 一种靶向挖掘乳酸菌蛋白质资源的方法
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