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申请/专利权人：湖南师范大学

摘要：本发明属于生物信息技术领域，具体涉及一种蛋白质质谱鉴定方法、系统、设备及存储介质，将由理论肽离子组成的所述第一序列和质谱峰离子组成的第二序列，首先通过所述第一序列和第二序列的离子匹配度，对所述第一序列进行筛选得到第三序列，然后通过的第二序列生成的肽段，将肽段与所述第一序列匹配，按照匹配的肽段长度筛选，得到第四序列，第三序列和第四序列组成候选序列，然后将第二序列与候选序列粗糙对齐和精准对齐，生成有向无环图，根据有向无环图得到候选蛋白质，通过打分函数对候选蛋白质筛选，得到鉴定结果。本申请具有提高蛋白质质谱的识别准确性的效果。

主权项：1.一种蛋白质质谱鉴定方法，其特征是，包括：根据蛋白质参考序列，构建由理论肽段离子组成的第一序列，所述第一序列的数量为多个；获取待鉴定的蛋白质对应的质谱文件，对质谱文件中的每条质谱，构建由质谱峰离子组成的第二序列；比较所述第一序列和所述第二序列中的离子的质量，得到离子质量在误差范围内的所述第一序列的离子的数量，根据所述离子的数量以及匹配度公式，计算所述第一序列与所述第二序列的离子匹配度，选择离子匹配度靠前的n个所述第一序列作为第三序列；根据所述第二序列中质谱峰离子的质量之间的差值，得到对应的肽段tag，将所述肽段tag与多个所述第一序列匹配，得到每条所述第一序列所能匹配的最长的肽段tag长度，将所述第一序列按照所能匹配的最长肽段tag按照长度排序，选择前m个所述第一序列作为第四序列，将所述第三序列和所述第四序列组合作为候选序列；基于连续小波动态时间规整算法，将所述第二序列与所述候选序列粗糙对齐，得到所述第二序列的离子与所述第一序列的离子的映射关系，根据所述映射关系、所述第二序列以及所述第一序列得到粗糙对齐序列，所述映射关系为所述第二序列中的一个或者多个离子的离子质量与第一序列中的某个离子的离子质量在误差范围内相等或者存在质量差值；获取不同的可变修饰的修饰质量，根据所述映射关系以及所述不同的可变修饰的修饰质量，将所述粗糙对齐序列精准对齐，得到精准对齐序列；根据所述精准对齐序列建立有向无环图；从所述有向无环图中解析最优匹配路径，确定所述可变修饰的修饰位置，得到候选蛋白质变体；通过打分函数对所述候选蛋白质变体进行筛选，得到蛋白质质谱对应的最佳蛋白质变体，以所述最佳蛋白质变体的结构为待鉴定的蛋白质的结构。

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权利要求：

百度查询： 湖南师范大学 一种蛋白质质谱鉴定方法、系统、设备及存储介质