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申请/专利权人：北京泛生子基因科技有限公司;无锡泛生子生物科技有限公司;北京泛生子医学检验实验室有限公司

摘要：本发明涉及一种肿瘤基因检测报告自动化解读与管理的方法和系统，系统包括：模板创建单元、数据管理单元和报告审核单元；所述模板创建单元用于根据临床需求创建个性化报告模板；所述数据管理单元用于基于个性化报告模板获取患者检测样本的上游数据和医学解读信息，按照预设数据处理和解读逻辑生成自动化解读报告，并进行数据存储；所述报告审核单元用于根据生成的自动化解读报告创建报告审核任务，并根据预设排班管理规则发送到相应审核客户端，由相应审核客户端根据预设报告审核管理规则进行审核，同时对报告审核全流程进行管理，得到患者检测样本的终版解读报告。本发明可以广泛应用于医疗数据处理领域。

主权项：1.一种肿瘤基因检测报告自动化解读与管理的系统，其特征在于，包括：模板创建单元、数据管理单元和报告审核单元；所述模板创建单元用于根据临床需求创建个性化报告模板；所述数据管理单元用于基于个性化报告模板获取患者检测样本的上游数据和医学解读信息，按照预设数据处理和解读逻辑生成自动化解读报告，并存储报告相关数据；所述报告审核单元用于根据生成的自动化解读报告创建报告审核任务，并根据预设排班管理规则发送到相应审核客户端，由相应审核客户端根据预设报告审核管理规则进行审核，同时对报告审核任务全流程进行管理，得到患者检测样本的终版解读报告；所述数据管理单元包括数据调取模块、数据处理模块和数据存储模块；所述数据调取模块用于根据个性化报告模板获取患者检测样本的上游数据和医学解读信息；所述数据处理模块用于按照预设数据处理和解读逻辑对上游数据和医学解读信息进行处理和解读，生成自动化解读报告；所述数据存储模块用于存储报告相关数据，包括所述数据处理模块处理过的上游数据和医学解读信息；所述按照预设数据处理和解读逻辑对上游数据和医学解读信息进行处理和解读，生成自动化解读报告，包括：以病理诊断和检测结果为入参，按照预设调取逻辑分类调取对应的医学解读信息；其中，预设调取逻辑为：①对于靶药匹配数据，以上游数据中患者检测样本对应的癌种和基因变异为入参，在医学解读信息的“靶药匹配”类别中匹配出相应靶向用药指导信息调取到系统，包括靶向药物、用药证据、证据类型、敏感耐药；②对于分型预后数据，以上游数据中患者检测样本对应的癌种和基因变异为入参，在医学解读信息的“分型预后”类别中匹配出分型预后解析信息调取到系统，包括预后评估结果、证据、证据类型；③对于突变解析数据，以上游数据中患者检测样本对应的癌种和基因变异为入参，在医学解读信息的“突变解析”类别中匹配出变异解析描述信息调取到系统，包括变异的生物学功能和致癌性；④对于免疫治疗数据，以上游数据中患者检测样本对应的癌种和基因变异、TMB、MSI为入参，在医学解读信息的“免疫治疗”类别中匹配出免疫治疗疗效相关解析信息调取到系统，包括基因变异对免疫治疗起到正向还是负向作用；⑤对于化疗药物指导数据，以上游数据中患者检测样本对应的癌种和基因变异为入参，通过医学解读信息的“化疗药物”类别中匹配出化疗药物指导信息调取到系统，包括化疗药物的毒副作用、有效性和用药提示；⑥对于临床试验数据，以上游数据中患者检测样本对应的癌种和基因变异为入参，在医学解读信息的“临床试验”类别中匹配出变异和癌种及癌种亚型完全一致的临床试验数据调取到系统；⑦对于遗传风险解析数据，则以上游数据中患者检测样本对应的癌种和检测结果基因胚系变异为入参，在医学解读信息的“遗传解析”类别中匹配出药物、用药证据及遗传风险解析、证据类型、敏感耐药信息，调取到系统；按照预设数据处理和解读逻辑对调取的各类医学解读信息和上游数据进行处理，并按个性化报告模板配置要求生成自动化解读报告；其中，自动化解读报告的生成，包括：①对于调取的分型预后、突变解析、免疫治疗、化疗药物、遗传风险解析数据，处理后自动填充到个性化报告模板的对应子模块中；②对于靶药匹配数据和临床试验数据，按照预设数据处理和解读逻辑处理后分别填充到靶向用药指导子模块和临床试验子模块；其中，对靶药匹配数据处理时，包括：根据预设报告展示规则和自动化判断逻辑，确定医学解读信息中靶药信息及相关证据的证据等级及变异类型；根据预设靶药及证据筛选、排序的自动化逻辑规则，以及确定的各证据的证据级及变异类型，对靶药及证据进行筛选；其中，所述预设靶药及证据筛选、排序的自动化逻辑规则，包括：a、按药物和证据的敏感性或耐药性，分两段自动展示在报告中，所有敏感药物及证据在前，耐药性药物及证据在后；b、同一个药物，医学解读信息有高级别的证据时，不输出更低级别的证据；c、同一药物的证据集中展示；d、不同证据按级别排序；e、同一级别的证据按变异类型排序；临床试验分期时期由高到低排列；f、当遇到同一药物矛盾证据时，靶药解析证据按照证据本身等级排序；根据预设矛盾证据判断、等级判定及展示的自动化逻辑，对筛选后的靶药及证据进一步筛选和排序处理；所述报告审核单元包括排班管理模块、报告管理模块和任务管理模块；所述排班管理模块用于根据预设排班管理规则创建排班表，并按照预设分配原则将报告审核任务自动分配至当日当班审核人员；所述报告管理模块用于当日当班审核人员按照预设报告审核管理规则对自动化解读报告进行审核并监督记录自动化解读报告的状态，得到患者检测样本的终版解读报告；所述任务管理模块用于对报告审核任务进行全流程实时跟踪；所述排班管理模块包括账号及权限设置子模块、排班表创建子模块和审核任务分配子模块；所述账号及权限设置子模块用于根据审核人员的工作权限和工作内容，为各审核人员开通对应的账号并分配不同的权限；所述排班表创建子模块用于根据不同审核人员的工作权限和工作内容创建排班表，确定当日当班审核人员；所述审核任务分配子模块用于根据不同产品特性设置适用于不同场景的审核线，并将报告审核任务按照预设分配原则自动分配至当日当班审核人员；所述报告管理模块包括审核子模块和流程管理子模块；所述审核子模块用于各审核人员按照预设报告审核管理规则对自动化解读报告进行人工审核，并在审核完成后交付得到患者检测样本的终版解读报告；所述流程管理子模块用于对自动化解读报告的状态进行监督记录，记录内容包括患者检测样本信息、产品名称、机构、模板名称、癌种、任务类型、任务回退类型、初审审核状态、复审审核状态、报告生成时间、报告生成状态、发送状态、生信复审状态和审核路径；所述任务管理模块包括在线追踪子模块和报告查阅统计子模块；所述在线追踪子模块用于存储和查看每条报告审核任务的详细信息，对每条报告审核任务的全流程实时跟踪，包括任务状态、任务类型、审核进度、审核人、审核时间、是否异常；所述报告查阅统计子模块用于对系统内基因检测报告进行多维度查阅统计。

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