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申请/专利权人：西北农林科技大学
摘要：本发明公开了一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒：以黄牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增黄牛VAMP7基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型。与云岭牛、夏南牛、皮南牛和郏县红牛生产数据的关联分析显示，正常型个体的十字部高显著高于插入型和正常型个体。本发明通过在DNA水平上检测与云岭牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
主权项：1.检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法在黄牛分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法，包括以下步骤：以黄牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时荧光定量PCR扩增VAMP7基因的拷贝数变异区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型；所述的VAMP7基因的拷贝数变异区域位于VAMP7基因参考基因组序列AC_000170.1的14678001bp-14686000bp；所述的引物对P1为：上游引物F1：5’-GCTAGCGTGTACTTTTGGTGT-3’下游引物R1：5’-ACTTAGCTAAACAGTGGCTAGG-3’；所述的引物对P2为：上游引物F2：5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’下游引物R2：5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’；所述的拷贝数变异类型是根据2*2−ΔΔCt将定量结果分为的三类：插入型，2*2−ΔΔCt大于2；缺失型，2*2−ΔΔCt小于2；正常型，2*2−ΔΔCt等于2；具有正常型拷贝数变异类型的个体在生长性状上较优；所述生长性状为十字部高；所述黄牛选自云岭牛。
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