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申请/专利权人:集美大学
摘要:本发明公开了一种筛选盐适应PL7家族褐藻胶裂解酶的方法。包括结合CAZy和NCBI数据库检索获取PL7家族褐藻胶裂解酶的氨基酸序列集;再对其氨基酸序列信息进行分析,以盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶的盐适应特征指数为筛选依据进行特征排序,盐适应特征指数高的为高盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶,盐适应特征指数低的为低盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶。该方法借助于盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶的氨基酸序列偏好性质,通过数据库检索、特征值筛选等手段最终得到高效表达特定盐适应PL7家族褐藻胶裂解酶的基因工程菌,其表达的PL7家族褐藻胶裂解酶具有特定的盐环境适应性,可用于高盐或低盐环境的褐藻生物催化降解。
主权项:1.一种筛选盐适应PL7家族褐藻胶裂解酶的方法,其特征在于,包括以下步骤:样本集的建立:结合CAZy数据库和NCBI数据库,检索获取PL7家族褐藻胶裂解酶的氨基酸序列集;盐适应性特征值筛选:对上述氨基酸序列集中的氨基酸序列信息进行分析,再以盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶的盐适应特征指数为筛选依据进行特征排序,盐适应特征指数高的为高盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶,盐适应特征指数低的为低盐适应性PL7家族褐藻胶裂解酶;所述盐适应特征指数为碱性氨基酸数目占总蛋白的比值,即HKR%。
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权利要求:
百度查询: 集美大学 一种筛选盐适应PL7家族褐藻胶裂解酶的方法
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