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一种宏基因组学病原检测校准的方法 

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申请/专利权人:天津华大医学检验所有限公司;深圳华大基因股份有限公司;上海华大医学检验所有限公司

摘要:本发明公开了一种用于宏基因组学病原检测校准的方法。该方法通过对已建立的病原数据库进行分析评估,设立提示性指标—相似性系数S来实现对宏基因组学检测结果准确性的提升或对特定病原体检测灵敏度和准确性的提升。本发明提供的方法对于不同样本类型的宏基因组检测结果均具有适用性;在不增加实验流程和分析时间的前提下,可以有效校正病原体检测精度,对宏基因组检测结果中的病原体提供准确性提示;进而指导评估数据库构建过程中存在的漏检风险,指导优化流程。本发明对于指导临床医生进行结果判断和用于评估数据库准确性具有重要的应用价值。

主权项:1.一种宏基因组学病原检测校准的方法,包括如下步骤:1根据开展宏基因组学检测病原体的检测范围建立病原数据库,其至少包含病原体名称、类型、分类层级和参考基因序列;2将待测样本的测序数据和病原数据库进行生物信息学分析,获得待测样本中相应病原体的检出序列数;3分别统计步骤2获得的病原体的相似性系数S;4分别对步骤3中相似性系数S异常且具有临床致病意义的病原体进行分析,根据分析结果判断待测样本是否漏检该病原体或对该病原体的检测序列数进行校准。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 天津华大医学检验所有限公司 深圳华大基因股份有限公司 上海华大医学检验所有限公司 一种宏基因组学病原检测校准的方法

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