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申请/专利权人：安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要：本发明提供了一种基因组结构预测的方法及电子装置，该基因组结构预测的方法包括：S1）对多个样本的转录组测序序列进行组装，获得转录本组装序列；S2）将转录本组装序列与样本参考基因组序列进行比对，获得比对基因组序列；S3）将比对基因组序列进行基因组结构预测，获得基因组结构预测文件。能够解决现有技术中基因组结构预测文件的完整性差问题，适用于基因组结构预测领域。
主权项：1.一种基因组结构预测的方法，其特征在于，所述方法包括：S1）对多个样本的转录组测序序列进行组装，获得转录本组装序列；S2）将所述转录本组装序列与样本参考基因组序列进行比对，获得比对基因组序列；S3）将所述比对基因组序列进行基因组结构预测，获得基因组结构预测文件；所述样本的物种源自同一物种的样本；所述S1）包括：S1-1）对多个所述样本进行转录组测序，获得各所述样本的所述转录组测序序列；S1-2）对所有所述样本的所述转录组测序序列分别进行两两比对，筛选出重叠的区域；S1-3）利用组装软件，根据所述重叠的区域的序列信息，将所有所述样本的所述转录组测序序列进行组装，获得所述转录本组装序列；所述序列信息包括：所述重叠的区域的中的序列片段的长度、方向和位置；所述S1-1）中，所述转录组测序的方法包括Iso-seq转录组测序和或DirectRNASequenci转录组测序；所述S1-3）中，所述组装软件包括canu软件、hifiasm软件、Flye软件、wtdbg2软件、Falcon软件或Miniasm软件中的一种或多种。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 安诺优达基因科技(北京)有限公司 基因组结构预测的方法及电子装置
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