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一种土壤中根肿病生防菌B18的检测方法及应用 

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申请/专利权人:重庆市渝东南农业科学院(重庆市涪陵榨菜研究所)

摘要:本发明属于生防菌B18检测技术领域,公开了一种土壤中根肿病生防菌B18的检测方法及应用,首先基于B18gyrA基因设计特异性引物探针,优化反应条件,建立了B18微滴式数字PCR检测体系;该检测体系可特异性检测出B18,而对其它细菌检测结果为阴性,且灵敏度高,其检测下限可达0.69copiesμL,本发明还可以对土壤DNA样品中的B18进行绝对定量。本发明采用微滴式数字PCR技术对B18在土壤中的菌量变化进行实时监测,明确其在田间的消长规律,同时结合依托作物的发病程度及产量,其结果将为B18在田间的精准施用及后续的推广应用提供切实可靠的理论依据。

主权项:1.一种土壤中根肿病生防菌B18的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一,设计生防菌特异性引物及探针:采用质粒提取试剂盒Omega提取重组的克隆质粒,质粒PCR反应检测,紫外分光光度计测质粒浓度并进行测序;将测序序列在NCBI上比对后下载相应序列,根据此序列,利用在线引物设计工具设计gyrA基因特异性引物及探针;步骤二,B18引物探针特异性检测:利用设计好的引物探针以B18基因组DNA为阳性对照,其他供试细菌菌株基因组DNA为阴性对照,数字PCR扩增,检测引物的扩增特异性;步骤三,土样中B18菌量测定:将采集的土样用土壤DNA提取试剂盒提取土壤总DNA,用优化好的数字PCR反应体系进行扩增,根据公式算出土样中B18含量C1。

全文数据:

权利要求:

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