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一种隐藏寻址的DNA存储编码设计方法 

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申请/专利权人:大连大学

摘要:本发明公开了一种隐藏寻址的DNA存储编码设计方法,包括:首先要将信息转换为二进制数据,并将数据分组、组内分段。其次,在每组数据中通过喷泉编码方式将数据异或并转化为DNA序列。然后,将每组数据中满足约束条件的DNA片段保留。最后,从每组数据中选出能够代表此序列的索引片段及7个配合索引解码的DNA片段,依次连接并输出。本发明因为在组内的数据片段异或,转化为满足约束条件的DNA片段使得DNA序列的局部GC含量更稳定,提高了序列的测序正确性。同时选取的用于隐藏索引的DNA片段为数据异或产生,所以相似性较低,可以避免序列拼接过程中因为索引相似度过高导致的拼接错误。

主权项:1.一种隐藏寻址的DNA存储编码设计方法,其特征在于,包括:步骤1:获取输入数据并转换为二进制数据,将所述二进制数据进行分组,并在每组的数据内分段,根据分段情况生成鲁棒孤波度分布函数;步骤2:根据所述鲁棒孤波度分布函数确定一个度,再选取一个随机种子,所述种子与所述度一一对应;步骤3:在数据组内选取度个数据段进行异或,并将所述种子置于异或数据前形成异或数据段;步骤4:按照{00,01,10,11}→{A,C,G,T}的映射方式将所述异或数据段转化成DNA片段;步骤5:根据GC含量及均聚物筛选器的约束条件对所述DNA片段进行过滤,将满足约束条件的DNA片段暂且保留,不满足约束条件的DNA片段直接丢弃;步骤6:每组数据中都进行步骤2-5的操作,直至将所有种子用尽,该组数据编码完成;步骤7:将编码完成的每组数据都进行一个喷泉编码过程,实现由数据到DNA序列的转换。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 大连大学 一种隐藏寻址的DNA存储编码设计方法

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