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申请/专利权人：江苏理工学院
摘要：本发明涉及生物分子结构弛豫可视化交互方法及装置，所述方法包括：S1.接收导入的生物分子结构文件，并进行解析，以及根据解析结果构建生物分子三维模型；S2.对生物分子结构的空间位置进行交互式调整，以便于对生物分子结构进行观察；S3.基于生物分子三维模型进行交互式生物分子结构建模；S4.生物分子结构弛豫模拟；S5.生物分子结构弛豫终止。本发明使对生物分子的更多性能研究不再停留在最初设计的分子结构上，而是深入到分子结构微调和生物分子形状改变后的分子结构，从而对生物分子结构数据库进行了有效扩展，为基于生物大数据的人工智能应用节省大量人力、物力和财力，极大提高智能计算性能，提升药物设计和发现能力。
主权项：1.生物分子结构弛豫可视化交互方法，包括：S1.接收导入的生物分子结构文件，并进行解析，以及根据解析结果构建生物分子三维模型；S2.对生物分子结构的空间位置进行交互式调整，以便于对生物分子结构进行观察；S3.基于生物分子三维模型进行交互式生物分子结构建模；S4.生物分子结构弛豫模拟；S5.生物分子结构弛豫终止；所述的方法还包括基于以下设计来实施步骤S4：力学模型：力学环境包括共价键连接原子间的键长伸缩势能和非共价键连接原子间的兰纳-琼斯Lennard-Jones势能；共价键伸缩势能采用理想弹簧模型，通过虎克定律Hooke’slaw将共价键的拉升变形与原子受力定量为线性关系；加速度计算：Ft＝mat，其中，Ft为t时刻原子所受净力，m为原子质量，at为t时刻原子加速度；时间演化算法：引入Verlet算法进行各原子位置坐标和速度的迭代计算和更新；Verlet算法的基本原理是根据牛顿定律计算原子的位置和速度，采用离散时间补偿进行时间演化；位置更新：rt+Δt＝2rt-rt-Δt+atΔt2；其中，Δt为时间间隔，rt-Δt，rt和rt+Δt分别为t-Δt，t和t+Δt时刻的原子位置坐标；速度更新：vt＝[rt+Δt-rt-Δt]2Δt。
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百度查询： 江苏理工学院 生物分子结构弛豫可视化交互方法及装置
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