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申请/专利权人:中日友好医院(中日友好临床医学研究所)
摘要:本发明提供了一种重症社区获得性肺炎预后预测系统及装置,涉及机器学习技术领域,系统主要包括数据处理模块等;数据处理模块,包括宿主反应分析单元、模型单元、预后单元及数据库;模型单元存储并训练预测模型,基于目标基因进行分类并预测支气管肺泡灌洗样本对应宿主在预设期限时的病死率;预后单元通过预测模型,预测被测支气管肺泡灌洗液样本对应宿主在预设期限时的病死率;本方案利用重症社区获得性肺炎患者的支气管肺泡灌洗液样本,进行mNGS检测提取宿主转录组测序数据,并与相应患者的预后状态一起训练预测模型;再通过预测模型自动预测被测患者的预后情况。本方案预测准确性高、速度快,有助于改善患者的预后并辅助临床决策。
主权项:1.一种重症社区获得性肺炎预后预测系统,其特征在于,包括依次设置的数据采集模块、数据处理模块及结果生成模块;所述数据采集模块,包括第一采集单元,用于采集被测支气管肺泡灌洗液样本的RNA测序总序列;所述被测支气管肺泡灌洗液样本来自于重症社区获得性肺炎患者;所述重症社区获得性肺炎患者按照预设期限的预后状态,划分为死亡组和存活组;所述数据处理模块,包括宿主反应分析单元、模型单元、预后单元及数据库:所述宿主反应分析单元,用于从所述RNA测序总序列中提取对应宿主的宿主转录组测序数据并存储于数据库中;通过随机森林方法结合顺序向前特征选择算法,筛选死亡组与存活组之间的目标基因存储于数据库中;所述模型单元,存储并训练第一预测模型,该预测模型基于所述目标基因进行分类并预测支气管肺泡灌洗样本对应宿主在预设期限时的病死率;所述预后单元,基于被测支气管肺泡灌洗液样本对应宿主的宿主转录组测序数据,通过第一预测模型,预测被测支气管肺泡灌洗液样本对应宿主在预设期限时的病死率;所述结果生成模块,用于将上述预测结果外发。
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