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考虑校准物的通过宏基因组分析检测和定量感兴趣的生物物种的方法 

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申请/专利权人:生物梅里埃公司

摘要:本发明涉及用于检测潜在存在于分析样品中的感兴趣生物物种SOI的方法,所述SOI具有已知或部分已知的基因组,所述样品包含不同生物物种的混合物,所述方法包括:a从样品中提取核酸;b对a中提取的核苷酸序列进行测序;c基于排序结果:i基于序列参考数据库分配步骤b产生的序列;ii确定分配给SOI的序列量RSOI,RNSOI。所述方法包括在b之前向样品中添加校准物,所述校准物是以已知浓度添加的生物物种且具有已知基因组,并且c包含iii确定分配给校准物的序列量RCAL;d基于在ii和iii中估计的序列量,估计样品中SOI的浓度CSOI。

主权项:1.一种用于检测潜在地存在于分析样品中的感兴趣的微生物SOI的方法,所述样品先前提前自有机体或提前自工业过程或提取自环境,所述感兴趣的微生物具有已知或部分已知的基因组,所述分析样品包含多种微生物的混合物,所述方法包括以下步骤:a从所述分析样品中提取核酸;b对步骤a中提取的核苷酸序列进行测序;c基于测序结果:i基于序列参考数据库分配步骤b产生的序列;ii确定分配给感兴趣的微生物的序列量RSOI,RNSOI;所述方法的特征在于其包括在步骤a之前向所述分析样品中添加校准物,所述校准物是以已知浓度CCAL添加的微生物,所述校准物具有已知的基因组,并且步骤c包括:iii确定分配给所述校准物的序列量RCAL;d根据在步骤ii和iii中估计的序列量和所述校准物的浓度CCAL,估计所述样品中感兴趣的微生物SOI的浓度CSOI;其中步骤b通过测序仪进行;步骤i、ii和iii通过数据处理单元进行,所述数据处理单元与所述测序仪连接;步骤d通过计算单元进行。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 生物梅里埃公司 考虑校准物的通过宏基因组分析检测和定量感兴趣的生物物种的方法

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