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申请/专利权人：烟台市疾病预防控制中心
摘要：本发明涉及生物基因序列领域，尤其是涉及需要解析着丝粒区域结构的研究；本申请公开了一种用于解析基因组着丝粒区域解构的注释方法centroAnno，本申请提出的centroAnno，基于一种启发式策略来分析着丝粒序列的重复单元，期间涉及着丝粒序列的判定，当串联重复单元被识别，centroAnno基于串联重复单元信息得到一个邻接矩阵，并将HORs的解析问题转换为在邻接矩阵中寻找特定结构的图论问题，期间结合一种滑动窗口策略细化HORs的结构解析结果；相较于当前的主流着丝粒结构分析工具而言，本发明提出的工具能够准确识别着丝粒序列中的重复单体并准确实现HORs的解析，且具有明显的效率优势。
主权项：1.一种用于基因组中着丝粒区域的结构注释方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：S1：获取基因组的着丝粒区域序列；S2：通过启发式算法分析所述着丝粒区域；S3：结合图论和最优化理论进行数据处理；S4：识别和注释该区域的串联重复单元；S5：确定高阶串联重复模式；S6：将所述分析结果输出为结构注释报告。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 烟台市疾病预防控制中心 一种用于解析基因组着丝粒区域解构的注释方法
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